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データ名 ⇅	データベース名 ⇅	DOI ⇅	説明 ⇅	データファイル ⇅	簡易検索URL ⇅	データ取得方法 ⇅	解析方法 ⇅	データ件数 ⇅	データ詳細
cDNAクローンの発生時期別の局在画像リスト	Atlas (ISH Data Base)	10.18908/lsdba.nbdc00373-002	Dictyostelium discoideum cDNAクローンについて、Whole-mount in situ hybridization に基づく空間的遺伝子発現情報の画像の一覧。 990件。	dicty_atlas_image_list.zip (7KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dicty_atlas_db_image	-	-	990件	データ詳細 open_in_full
Dichot	Autophagy Database	10.18908/lsdba.nbdc01196-004	タンパク質の立体構造領域 (structural segments) と天然変性領域 (intrinsically disordered segments) を予測する手法であるDICHOT 法 (Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26) を使い、オートファジー関連タンパク質の立体構造領域と天然変性領域を予測したデータ。	autophagy_dichot.zip (66.9 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/autophagy_dichot	-	DICHOT 法 (Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26)	1,637 件	データ詳細 open_in_full
Homologs	Autophagy Database	10.18908/lsdba.nbdc01196-005	オートファジー関連タンパク質の複数生物種間のオーソログ・ホモログのリスト。簡易検索サイトにおける遺伝子シンボルの文字列の色は、それぞれ以下のランクを表している。 1 reviewed 先生方から頂いたリストやオートファジーの雑誌、レビュー等から抜粋したタンパク質 2 orthologous オーソログ探索を行った論文から抜粋したタンパク質 3 homologous 配列による相同性検索の結果、ホモログの可能性があるタンパク質。ただしアノテーションがついていないタンパク質は灰色で表示される。	autophagy_homolog.zip (60.1 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/autophagy_homolog			465 件	データ詳細 open_in_full
PI3P	Autophagy Database	10.18908/lsdba.nbdc01196-006	オートファジーの進行過程で必須なリン脂質であるホスファチジル・イノシトール3リン酸 (PI3P) に結合する可能性の高いタンパク質のリスト。リスト中のタンパク質は、FYVE ドメインを持つものであるか、またはPX ドメインを持つもののうちでPI3P に特異的に結合すると予測されるものである。	autophagy_pi3p.zip (46.9 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/autophagy_pi3p	-	-	2,437 件	データ詳細 open_in_full
Protein List	Autophagy Database	10.18908/lsdba.nbdc01196-001	オートファジー関連タンパク質とそのホモログのリスト。	autophagy_protein.zip (10.4 MB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/autophagy_protein	・オートファジーに関する雑誌やレビューからの抜粋。・オートファジー関連タンパク質のオーソログ探索を行った論文からの抜粋。・上記のタンパク質に対して配列による相同性検索 (PSI-BLAST) を行ったの結果、ホモログである可能性があるもの。(閾値 1e-100 以下)	-	21,767 件	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データファイル	簡易検索URL	データ取得方法	解析方法	データ件数	データ詳細