「カイコ参照トランスクリプトームデータ」(農研機構生物機能利用研究部門/農業情報研究センター 横井翔主任研究員)を追加しました。
「カイコ参照トランスクリプトームデータ」は、カイコの新規参照ゲノム配列とカイコP50T系統における複数の器官由来のRNAseqデータから確立した参照トランスクリプトームデータとその関連データです。
「GGGenome dataset」(ライフサイエンス統合データベースセンター 内藤雄樹特任助教)を追加しました。
「GGGenome dataset」は、ゲノムや転写産物から塩基配列を高速に漏れなく検索するツールであるGGGenome用の検索データです。
「KNApSAcK Core」(奈良先端科学技術大学院大学 金谷重彦教授)を更新しました
「KNApSAcK Core」は、二次代謝物と生物種の関係についてのデータベースです。
今回の更新では、生物種-代謝物関係データのデータ項目およびレコードを追加しました。
「科学技術用語形態素解析辞書」(バイオサイエンスデータベースセンター)のデータを更新しました。
「科学技術用語形態素解析辞書」は、JSTシソーラスの見出し語と同義語を、形態素解析エンジンMeCabのユーザー辞書として使える形にしたものです。
今回は「JSTシソーラス見出し語・同義語辞書」を更新しました。ライフサイエンス分野と電子計算機分野の同義語の読みをNBDCで独自に付与しています。
「AOE」(ライフサイエンス統合データベースセンター 坊農秀雅特任准教授)を追加しました。
「AOE」は、公共データベースに登録された遺伝子発現データについて、各種統計情報から検索・閲覧・比較することができるデータベースです。
「FANTOM5」(理化学研究所)のデータを更新しました
「FANTOM5」は、ヒトやマウスの様々な細胞種における転写産物や転写因子の活性に関するデータベースです。
今回の更新では、以下の5つのデータを新たに追加しました。
- 「DRA_accession_tables」
- 「Gene_level_expression」
- 「Summary_CAGEScan 」
- 「(reprocessed)Enhancers」
- 「(reprocessed)DPI_clustering」
また、以下の9つのデータを更新しました。
- 「HeliscopeCAGE sequencing, Delve mapping and CAGE TSS aggregation」
- 「(reprocessed)HeliscopeCAGE sequencing, Delve mapping and CAGE TSS aggregation」
- 「CAGE peaks」
- 「(reprocessed)CAGE peaks」
- 「(reprocessed)CAGE_peaks_annotation」
- 「(reprocessed)CAGE_peaks_expression」
- 「(reprocessed)pooled_ctss」
- 「Enhancers」
- 「Sample ontology, GOstat and ontology term enrichment」
「PoSSuM」(産業技術総合研究所 富井健太郎研究チーム長)を追加しました
「PoSSuM」は、タンパク質上の低分子結合サイトを推定するためのデータベースです。
「ChemTHEATRE」(愛媛大学 仲山慶講師)を追加しました
「ChemTHEATRE」は、環境中の化学物質のモニタリング結果を集めたデータベースです。
「医学・薬学予稿集全文データベース」(ライフサイエンス統合データベースセンター 川本祥子准教授)を追加しました
「医学・薬学予稿集全文データベース」は、医学・薬学関係の学会や研究会、医師会の年会・大会・集会の予稿集に掲載された記事の書誌情報とスキャン画像のデータベースです。
「ライフサイエンス 新着論文レビュー」(ライフサイエンス統合データベースセンター 飯田啓介特任研究員)を追加しました
「ライフサイエンス 新着論文レビュー」は、日本人を著者とする生命科学分野の論文について、論文の著者自身の執筆による日本語のレビューです。