GGGenome dataset
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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GGGenome dataset
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名称の読み方
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ゲゲゲノムデータセット |
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別名
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- |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01424-000 |
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作成者
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作成氏名
内藤 雄樹*   
作成者英名
Yuki Naito*
作成者所属
ライフサイエンス統合データベースセンター
作成者の文献検索
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連絡先
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https://dbcls.rois.ac.jp/contact.html |
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データベース分類
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塩基配列データベース |
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データベースの説明
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GGGenomeは、ゲノムや転写産物から塩基配列を高速に漏れなく検索するツールです。GGGenomeは、Web上で利用できる(https://GGGenome.dbcls.jp/)他、Dockerコンテナとしても配布しています。GGGenomeのDockerコンテナを利用する場合、本データセットを組み込む必要があります。Dockerコンテナの配布については、上記連絡先までお問合せください。
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データベースの特長・有用性・活用方法
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GGGenomeは、ミスマッチや挿入・欠失を含む短い塩基配列でも漏れなく検索できます。 |
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データベースの利用許諾
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CC 表示 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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名称
文部科学省「ライフサイエンス統合データベース」プロジェクト
名称
ライフサイエンスデータベース統合推進事業 
名称
データベース統合に関わる基盤技術開発 |
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論文等
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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オリジナルサイト
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https://GGGenome.dbcls.jp/ |
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運用開始年月日
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2012/07/04 |
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最終更新年月日
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2019/07/31 |
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統括サイト
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https://dbcls.rois.ac.jp/ |
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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一覧表示
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無し |
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クエリ検索
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有り |
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Webサービス
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有り |
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WebサービスURL
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https://GGGenome.dbcls.jp/ |
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ユーザ登録
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無し |