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このデータベースについて

生物種-代謝物関係データ

データ説明
データ名
生物種-代謝物関係データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V003
バージョン
V3 10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V003 更新履歴
V2 10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V002 更新履歴
V1 10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V001 -
データ内容の説明
生物種とその生物における代謝物の関係について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
データファイル
データファイル名 :
knapsack_core.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2.3 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/knapsack_core
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

50,110種の代謝物と116,316対の生物種

データ詳細
項目名 項目の説明
C_ID

代謝物と生物種の対毎に付与されたID

CAS RN

CAS登録番号

Metabolite

代謝物の名称

Molecular Formula

代謝物の組成式

Organism

生物種名

Kingdom

生物種の界名

Family

生物種の科名

Genus

生物種の属名

SMILES

代謝物の組成式をSMILESで表したもの

InChI

代謝物の組成式をInChIKeyで表したもの

InChIKey

代謝物の組成式をInChIKeyで表したもの

Reference

参考

Structural formula

代謝物の組成式画像ファイル名(簡易検索ではサムネイルを表示)