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酵素/修飾酵素反応リスト	jPOSTリポジトリ	10.18908/lsdba.nbdc01594-006.V002	酵素/修飾酵素反応のリストです「プロファイルリスト」から参照されます			データ詳細 open_in_full
Allele Frequency	JSNP	10.18908/lsdba.nbdc00114-002	各多型の日本人集団におけるアレル頻度。多型84,651件のうち、13件は3種の集団(POP_)で、39件は2種の集団（RIKEN_japanese_）で頻度を調べている。「Flat ｆiles」 ftp://ftp.hgc.jp/pub/hgc/db/snp/alleleFreq140508.txt として提供されていた。	多型探索実験と同じプライマーを用いて、Panel_IDで示す日本人集団のDNAサンプルを鋳型にマルチプレックスPCR法で増幅を行い、インベーダーアッセイ法（JBIC-allele、RIKEN_japanese_）、TaqManアッセイ法（RIKEN-allele）、直接配列決定 / allelic discrimination chemistries / restriction enzyme genotyping 法（POP_）のいずれかにより遺伝子型を決定した。	-	データ詳細 open_in_full
Flat Files	JSNP	10.18908/lsdba.nbdc00114-006	多型（SNPと挿入／欠失）情報とそれらの前後配列、および日本人集団におけるアレル頻度。「Flat ｆiles」 ftp://ftp.hgc.jp/pub/hgc/db/snp/ にて提供されていた。	「Polymorphism Sequence」「Allele Frequency」と同等	-	データ詳細 open_in_full
Integrated List	JSNP	10.18908/lsdba.nbdc00114-005	「マッピング情報」と「多形探索実験情報」を多型ごとにまとめたリスト。ただし、２つ以上の染色体にマッピングされる場合は染色体ごとに別エントリとしている。「各種リスト」 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/search_list.html の「Show List by Chromosome」で提供されていた。	データ「Screening Information」「Mapping Information」より	-	データ詳細 open_in_full
Mapping Information	JSNP	10.18908/lsdba.nbdc00114-004	多型をゲノムにマッピングした結果。「Dump JSNP」 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/map/cgi-bin/Dump/snp_region_filter.cgi より提供されていた。	データ「Screening Information」「Allele Frequency」より	多型前後配列をRefSeq（GRCh37）のゲノムコンティグ配列（NT）（MaskerAidで反復配列をマスキング済）にBLASTでマッピング。前処理として多型探索実験時の選択領域をe-PCRで絞り込み。	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データ取得方法	解析方法	データ詳細