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項目名 項目の説明
codon_posi

コドン中の多型の位置

dbsnp_rs_id

dbSNPにおけるrs (reference SNP) number

dbsnp_ss_id

dbSNPにおけるss (submitted SNP) number

snp_id

JSNP ID

snp_type

多型の種類:SNPまたはIND(挿入/欠失)

5_flank_seq

多型の5'側の配列

na_var

塩基多型

3_flank_seq

多型の3'側の配列

for_primer

e-PCRにおけるフォワードプライマー塩基配列

back_primer

バックワードプライマー塩基配列

product_size

PCR産物の配列長

freq_minor

JSNPオリジナルのマイナーアレル頻度(-1:頻度情報なし)

freq_major

JSNPオリジナルのメジャーアレル頻度

chr

多型がマッピングされた染色体番号

chr_start

染色体上の多型の開始位置

chr_end

染色体上の多型の終了位置

chr_direct

染色体に対する前後配列の向き

contig_acc

多型がマップされたゲノムコンティグ(RefSeq NT)のアクセッション番号

contig_start

ゲノムコンティグ上の多型の開始位置

contig_end

ゲノムコンティグ上の多型の終了位置

contig_direct

ゲノムコンティグに対する前後配列の向き

hit_count

ゲノム全体に対して多型をマップできた位置の数

gene_na_acc

多型をマップした遺伝子(RefSeq NM/XM)のアクセション

gene_aa_acc

多型をマップした遺伝子(RefSeq NP/XP)のアクセション

symbol

多型をマップした遺伝子の略称

locus_id

多型をマップした遺伝子(LocusLink)のID

gene_direct

遺伝子の向きに対する前後配列の向き

+:同じ場合
-:異なる場合

str_type

多型がマップされた遺伝子構造
CDS、exon、intron、5'-UTR、3'-UTR

aa_var

アミノ酸残基の変化

codon_var

コドンの変化