データのメタデータ検索
全 696 件 (56件から60件)
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| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| タンパク質結合による構造変化の補助データ | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-002 |
二面角φ、ψのZ scoreをもとに、構造変化の大きい部位のデータを登録する。 |
タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank), 機能部位 |
重ね合わせたタンパク質立体構造の二面角の変化を計算し、構造変化の大きい部位を求めるために二面角変化のZ scoreを計算し、閾値よりZ scoreの大きい領域を決める。 |
データ詳細
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| 構造的ゆらぎデータ | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-004 |
タンパク質立体構造データベースPDBの温度因子の値を用いて、構造的ゆらぎ(構造がゆらいでいる)領域を登録する。 |
タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank) |
構造的ゆらぎの大きい部位を求めるために、温度因子の値のZ soreを計算し、Z scoreの大きい領域を決める。 |
データ詳細
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| 構造解析結果 | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-005 |
PDBファイルの構造解析を行った結果(生データ)
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データ詳細
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| 進化的構造変化データ | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-003 |
タンパク質配列の置換や挿入・欠損などによる構造変化の情報を登録する |
タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank) |
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データ詳細
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| InCeP | CREATE portal | 10.18908/lsdba.nbdc00403-002 |
mKIAAの細胞内情報伝達経路 |
免疫沈降:成体マウスの組織もしくは培養細胞株の抽出液を用いて抗mKIAA抗体を用いた免疫沈降を行いました。
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質量分析:LC-MSによる質量分析の結果をMascot解析し、共沈したタンパク質を予想しました。
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データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |