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ConfC
進化的構造変化データ
データ説明
データ名
進化的構造変化データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00400-003
データ内容の説明
タンパク質配列の置換や挿入・欠損などによる構造変化の情報を登録する
データファイル
データファイル名:
confc_ev.zip
データのURL:
ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/confc/LATEST/confc_ev.zip
ファイルサイズ:
373 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/confc_ev
データ取得方法
タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank)
解析方法
-
データ件数
169,962 件
データ詳細
項目名
項目の説明
confEVID
このテーブルのID
pdbIDA
構造比較したPDBのID(A)
pdbIDB
構造比較したPDBのID(B)
pdbChainA
構造比較したPDBのチェインID(A)
pdbChainB
構造比較したPDBのチェインID(B)
identity
配列一致率
indelSize
解析した挿入・欠損の数
alignment
配列のアライメント
indel
挿入・欠損の解析結果
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