データのメタデータ検索
全 696 件 (51件から55件)
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| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| EST配列一覧 | Chlamydomonas reinhardtii EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00028-001 |
クラミドモナスのEST配列データの一覧。CSV形式のテキストファイル。 データ件数は51,011件。 |
キャピラリーシーケンサー |
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データ詳細
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| クラスター | ClEST | 10.18908/lsdba.nbdc01137-002 |
Blastx相同性検索やGOアノテーションを含むクラスター情報 |
「Clone」データ |
Phred/phrapによるクラスタリング、NCBIのNon-redundantタンパク質データベースに対するBlastx相同性検索、Blast2GOを用いたGOアノテーションとDescriptionの記載 |
データ詳細
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| クローン | ClEST | 10.18908/lsdba.nbdc01137-001 |
トコジラミESTクローン情報 |
ABI3130xlを用いたサンガーシークエンス法による５’側からの配列決定 |
phredによるベースコール |
データ詳細
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| タンパク質立体構造イメージ | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-006 |
構造的ゆらぎのあるタンパク質立体構造のイメージ
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データ詳細
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| タンパク質結合による構造変化のデータ | ConfC | 10.18908/lsdba.nbdc00400-001 |
タンパク質配列の相同性が90%以上で、重ね合わせたタンパク質構造の原子間の距離が20Å以上のタンパク質ペアを登録する。 |
タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank) |
重ね合わせたタンパク質立体構造の二面角の変化を計算し、構造変化の大きい部位を求めるためにZ soreを計算した。 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |