データのメタデータ検索
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| Rice1265 Array: PCR check | RMOS | 10.18908/lsdba.nbdc00194-004 |
Rice1265マイクロアレイ(Full insert version)/(3'UTR version)に使用されたクローンについてPCR check結果をまとめたリスト |
パイロット実験としてRGP(rice genome research program)のcDNAコレクションの中から1265クローンを選び出し、PCRとゲル電気泳動によってユニーククローンかどうかを調べました。 |
3' UTRのチェックにはUpper primerとLower primer (Rice8987Corresponding Table(f_g_primer参照)) を、インサート全長 (Full)の場合はM13 RV primer とM4 primer(TAKARA)を使用してPCRを行いました。ゲル電気泳動によって増幅断片の大きさと個数をチェックしました。 |
データ詳細
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| Rice8987 Array: PCR check | RMOS | 10.18908/lsdba.nbdc00194-005 |
Rice8987マイクロアレイ(f_array/Full insert version)に使用されたクローンについてPCR check結果等をまとめたリスト |
第1期イネゲノムプロジェクトにより集められた約4万クローンの中から選び出された8987クローンを使用し、PCRとゲル電気泳動によってユニーククローンかどうかを調べました。 |
3' UTRのチェックにはUpper primerとLower primer (Rice8987Corresponding Table (f_g_primer参照)) を、インサート全長 (Full) の場合はM13 RV primer とM4 primer (TAKARA) を使用してPCRを行いました。ゲル電気泳動によって増幅断片の大きさと個数をチェックしました。 |
データ詳細
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| Rice8987 Array: ゲル画像 | RMOS | 10.18908/lsdba.nbdc00194-006 |
Rice8987 Array(f_array/Full insert version)に使用された8987個のcDNAクローンの電気泳動ゲル画像 |
第1期イネゲノムプロジェクトにより集められた約4万クローンの中から独立した8987クローンが選び出されました。 |
ゲル電気泳動を使用することで、PCR反応をチェックしました。PCRには、M13 RV primerとM4 primer (TAKARA) を用いました。
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データ詳細
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| Rice8987 g_array: cDNA情報 | RMOS | 10.18908/lsdba.nbdc00194-007 |
Rice8987 Array(g_array/Full insert version)作成時のcDNA情報
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Rice8987 Array(g_array)作成に使用された8987クローンについて、cDNA情報をまとめました。 |
画像データを定量的に解析するソフトウェア「Array Gauge」(Fujifilm)のためのcDNA情報です。 |
データ詳細
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| Rice8987Corresponding Table (f_g_primer) | RMOS | 10.18908/lsdba.nbdc00194-009 |
Rice8987 Array の作成に用いたprimer(f_g_primer)情報のリスト |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |