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生命科学系データベースアーカイブ

RMOS

Rice8987 g_array: cDNA情報

データ説明

info データ名 Rice8987 g_array: cDNA情報
info DOI 
info データ内容の説明 

Rice8987 Array（g_array/Full insert version）作成時のcDNA情報
＊2002年7月1日以降のマイクロアレイは全てこのアレイ（g_array）が使用されています。 これまでに使用していたRice8987 Array（Full insert version）とスポットされているcDNAは同一ですが、ガラス上での並びが異なります。

info データファイル 
データファイル名:
rmos_rice9000array_g.csv.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/rmos/LATEST/rmos_rice9000array_g.csv.zip
ファイルサイズ:
453 KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

Rice8987 Array（g_array）作成に使用された8987クローンについて、cDNA情報をまとめました。

info 解析方法 

画像データを定量的に解析するソフトウェア「Array Gauge」（Fujifilm）のためのcDNA情報です。

info データ件数 

9,216 件

データ詳細

項目名項目の説明
Element No. (Glass) エレメント番号 (アレイgrass上の位置情報：「アレイパターンとクローン配置」参照)
Spot No. スポット番号
Clone name クローン名
Putative Gene Identification クローン配列から推定されたGene Identification
Destination Plate (96) PCRチェックを行う際に使用した96穴Destination Plate番号
Dplate Pos. PCRチェックを行う際に使用した96穴Destination Plate上での位置
Source Plate Name Source Plate名
*現在データ無し
Clone Pos in STAFFDWP STAFFDWP（STAFFでの保管に使用されていたDeep Well Plate）でのクローン位置
*現在データ無し
Accession No. (A) DDBJアクセッション番号（Aがついたクローン名のもの）
Accession No. (Z) DDBJアクセッション番号（Zがついたクローン名のもの）
Primer No. プライマー番号
*現在データ無し
to Full Spot No.

フルスポット番号へ
*現在データ無し
384Plate マイクロアレイ作成時にcDNAのスポッティングに用いた384穴Plateの番号
384Plate Pos. マイクロアレイ作成時にcDNAのスポッティングに用いた384穴Plate上の位置