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このデータベースについて

Rice8987 g_array: cDNA情報

データ説明
データ名
Rice8987 g_array: cDNA情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00194-007
データ内容の説明
Rice8987 Array(g_array/Full insert version)作成時のcDNA情報 *2002年7月1日以降のマイクロアレイは全てこのアレイ(g_array)が使用されています。 これまでに使用していたRice8987 Array(Full insert version)とスポットされているcDNAは同一ですが、ガラス上での並びが異なります。
データファイル
データファイル名 :
rmos_rice9000array_g.csv.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
453 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rmos_rice9000array_g
データ取得方法

Rice8987 Array(g_array)作成に使用された8987クローンについて、cDNA情報をまとめました。

解析方法

画像データを定量的に解析するソフトウェア「Array Gauge」(Fujifilm)のためのcDNA情報です。

データ件数

9,216 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Element No. (Glass)

エレメント番号 (アレイgrass上の位置情報:「アレイパターンとクローン配置」参照)

Spot No.

スポット番号

Clone name

クローン名

Putative Gene Identification

クローン配列から推定されたGene Identification

Destination Plate (96)

PCRチェックを行う際に使用した96穴Destination Plate番号

Dplate Pos.

PCRチェックを行う際に使用した96穴Destination Plate上での位置

Source Plate Name

Source Plate名*現在データ無し

Clone Pos in STAFFDWP

STAFFDWP(STAFFでの保管に使用されていたDeep Well Plate)でのクローン位置*現在データ無し

Accession No. (A)

DDBJアクセッション番号(Aがついたクローン名のもの)

Accession No. (Z)

DDBJアクセッション番号(Zがついたクローン名のもの)

Primer No.

プライマー番号*現在データ無し

to Full Spot No.

フルスポット番号へ*現在データ無し

384Plate

マイクロアレイ作成時にcDNAのスポッティングに用いた384穴Plateの番号

384Plate Pos.

マイクロアレイ作成時にcDNAのスポッティングに用いた384穴Plate上の位置