データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ナミキ商事化合物データ(Multiple Conformer) | LigandBox | 10.18908/lsdba.nbdc00551-002.V003 |
ナミキ商事株式会社から提供された化合物データです(2017年10月時点)。化合物が複数の配座異性体を持つ場合、それらを全て含んでいます。Mol2フォーマットで１つのファイルに記載されています。Mol2フォーマットの中のコメント部分を別途CSVファイルとしてまとめています。これは簡易検索で検索することができます。 |
ligandbox_namiki.zip（CSVフォーマット）
(495MB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/ligandbox_namiki |
ナミキ商事株式会社から提供 |
5,434,894件 |
データ詳細
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| 3'EST配列 | Lotus japonicus EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00552-003 |
ミヤコグサの3' EST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。 データ件数は74,458件。 |
Lotus_3dash.tar.gz
(11.9MB) |
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キャピラリーシーケンサー |
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74,458件 |
データ詳細
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| 5'EST配列 | Lotus japonicus EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00552-002 |
ミヤコグサの5' EST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。 データ件数は22,983件。 |
Lotus_5dash.tar.gz
(3MB) |
- |
キャピラリーシーケンサー |
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22,983件 |
データ詳細
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| EST配列一覧 | Lotus japonicus EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00552-001 |
ミヤコグサのEST配列データの一覧。CSV形式のテキストファイル。 データ件数は105,659件。 |
kazusa_lotus_est.zip
(11.2MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kazusa_lotus_est |
キャピラリーシーケンサー |
- |
105,659件 |
データ詳細
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| Iwate EST配列 | Lotus japonicus EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00552-004 |
ミヤコグサ(Iwate)の EST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。 データ件数は898件。 |
Lotus_iwate.tar.gz
(172KB) |
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キャピラリーシーケンサー |
- |
898件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |