データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kagawa EST配列 | Lotus japonicus EST index | 10.18908/lsdba.nbdc00552-005 |
ミヤコグサ(Kagawa)の EST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。データ件数は7,320件。 |
Lotus_kagawa.tar.gz
(1.3MB) |
- |
キャピラリーシーケンサー |
- |
7,320件 |
データ詳細
open_in_full
|
| EST | MAGEST | 10.18908/lsdba.nbdc00128-003 |
マボヤESTの配列情報。 102,190件。 |
magest_est.zip
(17.2MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/magest_est |
ABI PRISM 377 sequencer, Big-Dye dideoxy chain terminators |
- |
102,190件 |
データ詳細
open_in_full
|
| クローン | MAGEST | 10.18908/lsdba.nbdc00128-002 |
マボヤの各発生段階から得られたcDNAクローンの情報。60,037件。 |
magest_clone.zip
(530KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/magest_clone |
ホヤ受精卵を三田ら(Mita-Miyazawa et al., 1985)の方法で化学的にコリオン除去した後、 AGPCを用いてpoly(A) RNAを抽出（Chomczynski and Sacchi, 1987）し、 Oligotex-dT30ビーズ(Roche Japan, Tokyo)を用いて精製した。 5μgのpoly(A) RNAからoligo(dT)-primed cDNA libraryを作成した。 cDNAはlambda uni-ZAP cDNA synthesis kit (Stratagene)を用いて合成した後、精製した。 |
- |
60,037件 |
データ詳細
open_in_full
|
| コンティグ | MAGEST | 10.18908/lsdba.nbdc00128-001 |
マボヤESTをアセンブルして得られたコンセンサス配列のアノテーションや配列情報。11,299件。 |
magest_contig.zip
(5.37MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/magest_contig |
EGassembler |
- |
11,299件 |
データ詳細
open_in_full
|
| MassBank Raw Data | MassBank | 10.18908/lsdba.nbdc00298-002 |
各データ提供機関から収集されたマススペクトルデータ |
massbank_raw.zip
(62.7 MB) |
- |
各データ提供機関から、mass解析データを登録 |
45,260 件 |
データ詳細
open_in_full
|
|
| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |