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このデータベースについて

ナミキ商事化合物データ(Multiple Conformer)

データ説明
データ名
ナミキ商事化合物データ(Multiple Conformer)
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00551-002.V003
バージョン
V3 10.18908/lsdba.nbdc00551-002.V003 更新履歴
V2 10.18908/lsdba.nbdc00551-002.V002 更新履歴
V1 10.18908/lsdba.nbdc00551-002.V001 -
データ内容の説明
ナミキ商事株式会社から提供された化合物データです(2017年10月時点)。化合物が複数の配座異性体を持つ場合、それらを全て含んでいます。Mol2フォーマットで1つのファイルに記載されています。Mol2フォーマットの中のコメント部分を別途CSVファイルとしてまとめています。これは簡易検索で検索することができます。
データファイル
データファイル名 :
ligandbox_namiki.zip(CSVフォーマット)
データのURL :
ファイルサイズ :
495MB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/ligandbox_namiki
データ取得方法

ナミキ商事株式会社から提供

解析方法

-

データ件数

5,434,894件

データ詳細
項目名 項目の説明
LIGANDBOX_ID

LigandBox内のID

SINGLE

single conformerとして抽出された場合は"TRUE"そうでなければ"FALSE"

SOURCE

データ提供元

SOURCE_ID

データ提供元におけるID

MOLECULAR_FORMULA

分子式

MOLECULAR_WEIGHT

分子量

MOLECULAR_CHARGE

分子総電荷

NUM_OF_DONOR

水素結合ドナー原子数

NUM_OF_ACCEPTOR

水素結合アクセプタ原子数

NUM_OF_CHIRAL_ATOMS

光学活性中心原子数

TPSA

トポロジカル極性表面積

HOMO

最高被占軌道エネルギー値

LUMO

最低空軌道エネルギー値

LOGP

分配係数

LOGS

水に対する溶解度

INCHI

InChI

INCHI_KEY

InChIKey

MOL2_FILE

当該エントリのmol2ファイルのURL

SDF_FILE

当該エントリのsdfファイルのURL