データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RMOS blastn result | KOME | 10.18908/lsdba.nbdc00120-013 |
コメESTマイクロアレイ（G-アレイ）に対してblastn検索した結果 |
kome_rmos_blastn_result.zip
(74 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_rmos_blastn_result |
Rice Microarray Opening Site (RMOS)で公開されているイネゲノムデータを使用。 |
コメESTマイクロアレイ（G-アレイ）に対してblastn検索(blast2.2.12)を行った。（上部ヒットのみ）
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5,024 件 |
データ詳細
open_in_full
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| RPD link result | KOME | 10.18908/lsdba.nbdc00120-028 |
Rice Proteome Database におけるタンパク質を表示 |
kome_rpd_link_result.zip
(14 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_rpd_link_result |
完全長cDNAクローンに対応するRice Proteome Databaseにおけるタンパク質。 |
1,258 件 |
データ詳細
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| SwissProt search result | KOME | 10.18908/lsdba.nbdc00120-019 |
SwissProtプロテインデータベースに対してblastx検索した結果 |
kome_swissprot_search_result.zip
(30 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_swissprot_search_result |
データベースはSWISS-PROTプロテインデータベースを使用。 |
SWISS-PROTプロテインデータベースに対して、Blastxを行った。
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1,286,530 件 |
データ詳細
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| Tos17 link result | KOME | 10.18908/lsdba.nbdc00120-014 |
Tos17ミュータントクローンとの対応情報 |
kome_tos17_link_result.zip
(49 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_tos17_link_result |
イネミュータントパネルデータベースで公開されているTos17ミュータント隣接塩基配列を使用。 |
Tos17隣接塩基配列、完全長クローンをイネゲノムBACコンティグにマッピングし、互いに重複した部分があるものを対応していると予測した。
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2,864 件 |
データ詳細
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| Trimming information | KOME | 10.18908/lsdba.nbdc00120-030 |
該当クローンの塩基配列のうち、ベクター配列の混入であると予想される部分、ポリＡ配列であると予想される部分を排除済みの塩基配列。
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kome_trimming_information.zip
(63 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_trimming_information | 161 件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |