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このデータベースについて

Dichot

データ説明
データ名
Dichot
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01196-004
データ内容の説明
タンパク質の立体構造領域 (structural segments) と天然変性領域 (intrinsically disordered segments) を予測する手法であるDICHOT 法 (<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19402914" target="_blank">Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26</a>) を使い、オートファジー関連タンパク質の立体構造領域と天然変性領域を予測したデータ。
データファイル
データファイル名 :
autophagy_dichot.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
66.9 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/autophagy_dichot
データ取得方法

-

解析方法

DICHOT 法 (Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26)

データ件数

1,637 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Organism

タンパク質を生成する生物種の学名 (一般名)

Symbol

遺伝子の略称

Protein Accession

NCBI Protein データベースにおけるタンパク質のID (バージョン付きアクセション番号)

Length

タンパク質の配列長

Known Domains

DICHOT 法により立体構造領域と予測され、既存の立体構造とアミノ酸配列の相同性が認められた領域

Novel Domains

DICHOT 法により立体構造領域と予測されたが、既存の立体構造とアミノ酸配列の相同性が認められない領域

Disorder Regions

DICHOT 法により天然変性領域と予測された領域