- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
Autophagy Database
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
Autophagy Database
名称の読み方
オートファジーデータベース
別名
-
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01196-000
作成者
作成氏名
菅原 秀明*
作成者英名
Hideaki Sugawara
作成者所属
国立遺伝学研究所
作成者の文献検索
作成氏名
本間 桂一
作成者英名
Keiichi Homma
作成者所属
国立遺伝学研究所
作成者の文献検索
連絡先
〒411-8540 静岡県三島市谷田1111
創薬等支援技術基盤プラットフォーム情報拠点 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
E mail: autophagy address
データベース分類

タンパク質配列データベース
構造データベース-タンパク質構造
代謝系/シグナル伝達経路-タンパク質・タンパク質相互作用

データベースの説明

オートファジーデータベースは、多数の生物種におけるオートファジー関連タンパク質とそのホモログの情報を提供するデータベースである。
まず出芽酵母・ヒト・マウスにおいて実験的にオートファジー関連と示されたタンパク質を網羅的に収集した後、真核生物種におけるオーソログ、ホモログを同定し、機能、配列、立体構造、分子間相互作用などの情報や独自の実験解析結果を加えて公開している。関連論文リストは日々更新している。

データベースの特長・有用性・活用方法

オートファジー関連のタンパク質とそのホモログをキーワードで検索し、機能や立体構造などの情報を見ることができる。
またオートファジーの進行過程において必須なリン脂質であるホスファチジル・イノシトール3リン酸 (PI3P) に結合する可能性のあるタンパク質のリストも提供しており、それらのタンパク質の機能などの情報を見ることができる。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
-
論文等
文献名
The Autophagy Database: an all-inclusive information resource on autophagy that provides nourishment for research.
著者名
Homma K, Suzuki K, Sugawara H.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D986-90.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
http://www.tanpaku.org/autophagy/
運用開始年月日
2010/04/12
最終更新年月日
2014/08/26
統括サイト
http://www.tanpaku.org/
データの一括ダウンロードサイト
http://www.tanpaku.org/autophagy/download/download.html
参照先データベース

NCBI Protein, NCBI Nucleotide, NCBI Entrez Gene, NCBI UniGene, UniProt, PDBj, PubMed, GTOP

一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し