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データのメタデータ一覧
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データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細
プロジェクトの説明 The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis 10.18908/lsdba.nbdc00945-005

オリジナルサイトのトップページを起点として、静的なWebページをまとめたもの。
プロジェクトの説明が記述されている。

phenome_outline.zip
(377KB)
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データ詳細 open_in_full
生育データのグラフ The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis 10.18908/lsdba.nbdc00945-003

種子根、子葉鞘、第一葉、第二葉の生育の経時変化を表すグラフ。

growth_data_graph.zip
(36KB)
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4件
データ詳細 open_in_full
生育画像ファイルリスト The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis 10.18908/lsdba.nbdc00945-002

サンプル毎に生育画像ファイル名を縦一列に並べたリスト。

images_list.zip
(16KB)
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7件
データ詳細 open_in_full
系統および生育条件の一覧 The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis 10.18908/lsdba.nbdc00945-001

サンプル毎の系統および生育条件の一覧。

phenome_data.zip
(1KB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/agritogo_phenome_data_list

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データ詳細 open_in_full
Sequence Classification TMBETA-GENOME 10.18908/lsdba.nbdc00713-002

ゲノムの各アミノ酸配列に対し、統計的手法と機械学習を使って、β-バレル型膜タンパク質またはヘリックス型膜タンパク質の判別を行った結果の一覧。
統計的手法はアミノ酸、ジペプチド(連続2残基)、モチーフ(1残基ギャップを挟んだ2残基)の組成(出現頻度)に基づいて行い、機械学習はアミノ酸やジペプチドの組成を主な特徴量として用いて行った。

tmbeta_genome_sequence_classification.zip
(177 MB)
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tmbeta_genome_sequence_classification

アミノ酸配列はNCBIから取得。

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903,989 件
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データ名 データベース名 DOI 説明 データファイル 簡易検索URL データ取得方法 解析方法 データ件数 データ詳細