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データのメタデータ一覧

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データ名 ⇅	データベース名 ⇅	DOI ⇅	説明 ⇅	データファイル ⇅	簡易検索URL ⇅	データ取得方法 ⇅	解析方法 ⇅	データ件数 ⇅	データ詳細
シーケンサ情報	RPD	10.18908/lsdba.nbdc00191-003	気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列について、Blast検索により相同検索した結果の一覧です。	rpd_sequencer.zip (23 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rpd_sequencer		気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列をクエリとし、生物種をOryza sativaに限定したNRデータベースでBlast検索を行いました。このBlast検索には、ncbi-blast-2.2.28と、2013年10月時点のNRデータベースを使用しています。	3,376 件	データ詳細 open_in_full
スポット情報	RPD	10.18908/lsdba.nbdc00191-002	2次元ゲル電気泳動を行って得たスポットの一覧です。各スポットについて、分子量・等電点・発現量等の情報、および決定したアミノ酸配列に対する相同検索結果情報等をまとめました。	rpd_spot.zip (326 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rpd_spot	実験	2次元電気泳動画像に基づいてそれぞれのタンパク質を精製し、気相プロティンシーケンサーあるいは質量分析計でアミノ酸配列を決定しました。気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列については、Blast検索によって相同検索結果を得ました。質量分析計で決定したアミノ酸配列については、Mascot解析によって相同検索結果を得ました。	14,724 件	データ詳細 open_in_full
プロトコル	RPD	10.18908/lsdba.nbdc00191-006	プロテオーム解析に関する様々な手法のプロトコルです。	rpd_protocol_jp.zip (535 KB)	-	プロテオーム解析に関するプロトコルの説明のWebページを切り出し、index.htmlを付加してzipにまとめました。		-	データ詳細 open_in_full
画像ファイル	RPD	10.18908/lsdba.nbdc00191-005	ゲル画像、および関連する画像ファイルです。	rpd_gel_image.zip (38.5 MB)	-			ゲル画像: 23件, スポット番号付きゲル画像: 23 件, ゲル画像の縦軸横軸画像: 2 件, 個々のスポットのゲル拡大画像: 12,807 件, 「no_image.jpeg」: 1件	データ詳細 open_in_full
Images	RPSD	10.18908/lsdba.nbdc00749-002	イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造の画像ファイルです。	rpsd_images.zip (18.3 MB)	-			358 件	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データファイル	簡易検索URL	データ取得方法	解析方法	データ件数	データ詳細