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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
メダカ cDNAクローン情報 Medaka EST Database 10.18908/lsdba.nbdc01000-001

メダカcDNAの5'EST、3'ESTの配列情報や、5'、3'ごとにクラスタリングしたクラスター情報、blastxのトップヒット。47,017件。

ABI3700または3730XL

クラスタリング、blastxのトップヒット

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メダカ cDNAクローン毎のホモロジー検索(blastx)結果 Medaka EST Database 10.18908/lsdba.nbdc01000-002

メダカEST配列を、公共タンパク質データベース(NCBI nr)に対してblastxによる相同性検索を行った結果。 blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。1,078,478件。

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公共のタンパク質データベース(NCBIのnr)に対するblastx

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メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 Medaka EST Database 10.18908/lsdba.nbdc01000-003

クローン毎に遺伝子の発現の局在部位を画像で示したもの。924件。

In Situ Proを用いたin situ hybridization

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メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 画像ファイル Medaka EST Database 10.18908/lsdba.nbdc01000-004

メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 画像ファイル。1000個のJPEGファイルをZIP形式で圧縮している。 画像ファイル名は、(クローンのr clusterのID)+(.jpg)となる。

In Situ Proを用いたin situ hybridization

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メダカ cDNAライブラリ Medaka EST Database 10.18908/lsdba.nbdc01000-005

Medaka のcDNAライブラリ情報。3件。

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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細