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このデータベースについて

メダカ cDNAクローン毎のホモロジー検索(blastx)結果

データ説明
データ名
メダカ cDNAクローン毎のホモロジー検索(blastx)結果
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01000-002
データ内容の説明
メダカEST配列を、公共タンパク質データベース(NCBI nr)に対してblastxによる相同性検索を行った結果。 blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。1,078,478件。
データファイル
データファイル名 :
medaka_est_db_homology.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
25.1MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_homology/
データ取得方法

-

解析方法

公共のタンパク質データベース(NCBIのnr)に対するblastx

データ件数

1,078,478件

データ詳細
項目名 項目の説明
Clone name

クローン名

Value

blastx結果のE-value

Score

blastx結果のスコア

Hit

blastxによってヒットしたタンパク質の由来データベース名、ID、アノテーション。