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このデータベースについて

メダカ cDNAクローン情報

データ説明
データ名
メダカ cDNAクローン情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01000-001
データ内容の説明
メダカcDNAの5'EST、3'ESTの配列情報や、5'、3'ごとにクラスタリングしたクラスター情報、blastxのトップヒット。47,017件。
データファイル
データファイル名 :
medaka_est_db_clone.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
13.4MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_clone
データ取得方法

ABI3700または3730XL

解析方法

クラスタリング、blastxのトップヒット

データ件数

47,017件

データ詳細
項目名 項目の説明
Clone name

クローン名

F cluster

5'ESTのクラスター

R cluster

3'ESTのクラスター

Top blastx

blastxのトップヒット

Expression

Expression Patternにデータが存在する場合、クローン名が表示される。TogoDB版では、Expression Patternへのリンク

Link to UniGene

クローン名。TogoDB版では、UniGeneへのリンク

5' sequence

5'ESTの塩基配列

Link to dbEST(5' seq)

クローン名。TogoDB版では、5'ESTのNCBI dbESTへのリンク

3' sequence

3'ESTの塩基配列

Link to dbEST(3' seq)

クローン名。TogoDB版では、3'ESTのNCBI dbESTへのリンク