メダカ cDNAクローン情報

データ名

メダカ cDNAクローン情報

DOI

データ内容の説明

メダカcDNAの5'EST、3'ESTの配列情報や、5'、3'ごとにクラスタリングしたクラスター情報、blastxのトップヒット。47,017件。

データファイル

データファイル名:

medaka_est_db_clone.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

13.4MB

簡易検索URL

データ取得方法

ABI3700または3730XL

解析方法

クラスタリング、blastxのトップヒット

データ件数

47,017件

項目名	項目の説明
Clone name	クローン名
F cluster	5'ESTのクラスター
R cluster	3'ESTのクラスター
Top blastx	blastxのトップヒット
Expression	Expression Patternにデータが存在する場合、クローン名が表示される。TogoDB版では、Expression Patternへのリンク
Link to UniGene	クローン名。TogoDB版では、UniGeneへのリンク
5' sequence	5'ESTの塩基配列
Link to dbEST(5' seq)	クローン名。TogoDB版では、5'ESTのNCBI dbESTへのリンク
3' sequence	3'ESTの塩基配列
Link to dbEST(3' seq)	クローン名。TogoDB版では、3'ESTのNCBI dbESTへのリンク

このデータベースについて