- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
[ Japanese | English ]

データのメタデータ検索

キーワードで検索
項目で検索
全 696 件 (21件から25件)
件を表示
データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
cDNAクローンの発生時期別の局在画像リスト Atlas (ISH Data Base) 10.18908/lsdba.nbdc00373-002

Dictyostelium discoideum cDNAクローンについて、Whole-mount in situ hybridization に基づく空間的遺伝子発現情報の画像の一覧。 990件。

-

-

データ詳細 open_in_full
Dichot Autophagy Database 10.18908/lsdba.nbdc01196-004

タンパク質の立体構造領域 (structural segments) と天然変性領域 (intrinsically disordered segments) を予測する手法であるDICHOT 法 (Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26) を使い、オートファジー関連タンパク質の立体構造領域と天然変性領域を予測したデータ。

-

DICHOT 法 (Fukuchi et al. 2009, BMC Struct Biol. 9:26)

データ詳細 open_in_full
Homologs Autophagy Database 10.18908/lsdba.nbdc01196-005

オートファジー関連タンパク質の複数生物種間のオーソログ・ホモログのリスト。
簡易検索サイトにおける遺伝子シンボルの文字列の色は、それぞれ以下のランクを表している。

1
reviewed
先生方から頂いたリストやオートファジーの雑誌、レビュー等から抜粋したタンパク質

2
orthologous
オーソログ探索を行った論文から抜粋したタンパク質

3
homologous
配列による相同性検索の結果、ホモログの可能性があるタンパク質。
ただしアノテーションがついていないタンパク質は灰色で表示される。

データ詳細 open_in_full
PI3P Autophagy Database 10.18908/lsdba.nbdc01196-006

オートファジーの進行過程で必須なリン脂質であるホスファチジル・イノシトール3リン酸 (PI3P) に結合する可能性の高いタンパク質のリスト。
リスト中のタンパク質は、FYVE ドメインを持つものであるか、またはPX ドメインを持つもののうちでPI3P に特異的に結合すると予測されるものである。

-

-

データ詳細 open_in_full
Protein List Autophagy Database 10.18908/lsdba.nbdc01196-001

オートファジー関連タンパク質とそのホモログのリスト。

・ オートファジーに関する雑誌やレビューからの抜粋。
・ オートファジー関連タンパク質のオーソログ探索を行った論文からの抜粋。
・ 上記のタンパク質に対して配列による相同性検索 (PSI-BLAST) を行ったの結果、ホモログである可能性があるもの。(閾値 1e-100 以下)

-

データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細