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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
マウスRNAサンプルデータ(CAGE) FANTOM web resource 10.18908/lsdba.nbdc00448-011

CAGE法によって得られたマウスRNAのサンプルデータ。

CAGE法

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データ詳細 open_in_full
マウスサンプルデータ(qRT-PCR) FANTOM web resource 10.18908/lsdba.nbdc00448-007

定量リアルタイムPCR法によって得られたマウスのサンプルデータ。

定量リアルタイムPCR法

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データ詳細 open_in_full
遺伝子ノックダウンデータ FANTOM web resource 10.18908/lsdba.nbdc00448-005

予測された転写制御ネットワークを確認するために、少数の転写因子に対して行われたsiRNAによる遺伝子ノックダウン実験のデータ。

siRNAによる遺伝子ノックダウン

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データ詳細 open_in_full
(reprocessed)CAGE peaks FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-002.V003

CAGE法で計測したヒト及びマウスのRNA転写開始活性に関するピーク領域のデータ。新たな参照配列(hg38/mm10)を使って再度マッピングを行った。

CAGE法
DPI(Decomposition-based peak identification)法

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(reprocessed)CAGE_peaks_annotation FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-011.V003

CAGE法で計測したヒト及びマウスのRNA転写開始活性に関するピーク領域のアノテーション情報。新たな参照配列(hg38/mm10)に対して再度マッピングを行った。

CAGE法

データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細