データのメタデータ検索
全 696 件 (176件から180件)
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| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ詳細 |
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| (reprocessed)CAGE_peaks_expression | FANTOM5 | 10.18908/lsdba.nbdc01389-012.V003 |
CAGE法で計測したヒト及びマウスのRNA転写活性に関するピーク領域の発現情報。新たな参照配列(hg38/mm10)を使って再度マッピングを行った。 |
CAGE法 |
データ詳細
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| (reprocessed)DPI_clustering | FANTOM5 | 10.18908/lsdba.nbdc01389-018.V003 |
ヒトおよびマウスの再マッピングデータ(data-8へのリンク)に対してDPI(Decomposition-based peak identification)法を用いてピークを同定した結果(BED形式ファイル)。
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データ詳細
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| (reprocessed)Enhancers | FANTOM5 | 10.18908/lsdba.nbdc01389-017.V003 |
CAGE法を用いてRNAの転写量を計測し、同定したヒトおよびマウスのエンハンサーのデータ。新たな参照配列(hg38/mm10)を用いて解析し直した。 |
CAGE法 |
データ詳細
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| (reprocessed)HeliscopeCAGE sequencing, Delve mapping and CAGE TSS aggregation | FANTOM5 | 10.18908/lsdba.nbdc01389-008.V003 |
FANTOM5プロジェクトにおいて、HeliScopeCAGE法を使って得られた、 経時変化のデータおよびある時点のスナップショットのデータ。phase2.0で得られたヒト及びマウスのリード配列に対して、新たな参照配列(hg38/mm10)を使って再度マッピングを行った。
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HeliScopeCAGE法 (http://fantom.gsc.riken.jp/protocols/heliscope.html)
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データ詳細
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| (reprocessed)pooled_ctss | FANTOM5 | 10.18908/lsdba.nbdc01389-013.V003 |
phase1.0から2.0までに使用したヒト及びマウスの全CAGEタグ配列のマッピング情報。新たな参照配列(hg38/mm10)を使って再度マッピングを行った。 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データ取得方法 | 解析方法 | データ詳細 |