データのメタデータ検索

全 696 件 (636件から640件)

件を表示

データ名 ⇅	データベース名 ⇅	DOI ⇅	説明 ⇅	データ取得方法 ⇅	解析方法 ⇅	データ詳細
マウス生殖系列のSBトランスポゾン挿入部位データ	Transposon insertion site database - germline	10.18908/lsdba.nbdc00718-001	マウス生殖系列のSBトランスポゾン挿入部位データ。トランスポゾン挿入マウス系統に関する実験関連情報（挿入位置に隣接する配列情報等）、挿入位置近傍の遺伝子に関する情報、及びトランスポゾン挿入位置に関する情報をリストしている。	Ligation-mediated PCR (LM-PCR)	-	データ詳細 open_in_full
EST配列	Trifolium pratense EST index	10.18908/lsdba.nbdc00782-002	ムラサキツメクサのEST配列データ。1配列につき1ファイルのFasta形式。 FASTA形式のヘッダ部分に、AccessionとClone IDが記述される。データ件数は38,100件。	キャピラリーシーケンサー	-	データ詳細 open_in_full
EST配列一覧	Trifolium pratense EST index	10.18908/lsdba.nbdc00782-001	ムラサキツメクサのEST配列データの一覧。CSV形式のテキストファイル。データ件数は38,100件。	キャピラリーシーケンサー	-	データ詳細 open_in_full
tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ	tRNADB-CE	10.18908/lsdba.nbdc00720-001	tRNAの探索結果、キュレーションのデータ。tRNA 遺伝子の探査は、3 種の予測プログラム（tRNAScan-SE, Aragorn, tRNAfinder）を併用し、予測結果が一致しない場合には、エキスパートによる精査を行った。判定結果には以下の３種の判定が使用される。 - reliable tRNA gene　 (オリジナルサイトでは○） - ambiguous case　（オリジナルサイトでは△） - not tRNA gene　（オリジナルサイトでは×）取得元によってデータのタイプが9種に分類され、それぞれの内訳は以下の通り。 - Prokaryotic complete genome: 95,512件 - Prokaryotic draft genome (WGS): 196,032件 - Plant: 1,608件 - Fungus: 2,773件 - Virus: 151件 - Phage: 962件 - Chloroplast: 4,376件 - Environmental sample (ENV) from GenBank: 101,837件 - Environmental sample (ENV) from Sequence Read Archive: 54,872件データ件数は、合計458,123件。 CSV形式のテキストファイル。	-	-	データ詳細 open_in_full
Protein	Trypanosomes Database	10.18908/lsdba.nbdc01243-001	タンパク質の情報（配列情報、機能情報、関連する代謝系の情報）をまとめた一覧です。タンパク質の候補阻害剤がある場合は、その化学物質の情報も得られます。	-	-	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データ取得方法	解析方法	データ詳細