Sequence Read Archive における Experiment ID に従って分類された ChIP-Seq データのメタデータのリスト。リファレンスゲノムデータ、抗原、細胞株の分類などの情報を含む。詳しくは https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#downloads_doc を参照のこと。

Sequence Read Archive からダウンロードしたデータを標準的なChIP-Seq データ解析パイプラインで処理することによって得られたデータに対して、人手でメタデータの整理を行った。

ChIP-Atlas において既報のChIP-Seq データを再解析し得られたデータをリファレンスゲノムデータごとに整理されたディレクトリ内で公開している。各Experiment ごとのデータはBigWig ファイル、Bed ファイル, BigBed ファイルを用意している。抗体と細胞種ごとに結合されたデータはBed ファイルを用意している。また、Target genes analysis およびColocalization analysis で用いたデータも公開している。詳細は https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#peak_browser_doc を参照のこと。
※過去バージョンのデータはダウンロードできません。

Sequence Read Archive からダウンロードしたデータを標準的なデータ解析パイプラインによって処理した。詳細はhttps://github.com/inutano/chip-atlas/wiki を参照のこと。