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生命科学系データベースアーカイブ

ConfC

タンパク質結合による構造変化のデータ

データ説明

info データ名 タンパク質結合による構造変化のデータ
info DOI 
info データ内容の説明 

タンパク質配列の相同性が90%以上で、重ね合わせたタンパク質構造の原子間の距離が20Å以上のタンパク質ペアを登録する。

info データファイル 
データファイル名:
confc_all.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/confc/LATEST/confc_all.zip
ファイルサイズ:
14.2 KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

タンパク質立体構造データベースPDB (Protein Data Bank)

info 解析方法 

重ね合わせたタンパク質立体構造の二面角の変化を計算し、構造変化の大きい部位を求めるためにZ soreを計算した。

info データ件数 

352 件

データ詳細

項目名項目の説明
confID このテーブルのID
classID 構造変化のクラスの情報も含むID
index レコードのインデックス
pdbIDA 構造比較したPDBのＩD（Ａ）
pdbIDB 構造比較したPDBのＩD（Ｂ）
pdbChainA 構造比較したPDBのチェインＩD（Ａ）
pdbChainB 構造比較したPDBのチェインＩD（Ｂ）
confDatafile 構造解析結果ファイル(zip形式)へのリンク
confClass 構造変化の種類（結合分子の種類）
confName 構造変化の名前（結合分子の情報）
dmax 重ね合わせたタンパク質構造の原子間距離の最大値
rmsd 重ね合わせたタンパク質構造のRMSD値
identity タンパク質配列の一致度