データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| メダカ cDNAクローン情報 | Medaka EST Database | 10.18908/lsdba.nbdc01000-001 |
メダカcDNAの5'EST、3'ESTの配列情報や、5'、3'ごとにクラスタリングしたクラスター情報、blastxのトップヒット。47,017件。 |
medaka_est_db_clone.zip
(13.4MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_clone |
ABI3700または3730XL |
クラスタリング、blastxのトップヒット |
47,017件 |
データ詳細
open_in_full
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| メダカ cDNAクローン毎のホモロジー検索(blastx)結果 | Medaka EST Database | 10.18908/lsdba.nbdc01000-002 |
メダカEST配列を、公共タンパク質データベース（NCBI nr）に対してblastxによる相同性検索を行った結果。 blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。1,078,478件。 |
medaka_est_db_homology.zip
(25.1MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_homology/ |
- |
公共のタンパク質データベース（NCBIのnr）に対するblastx |
1,078,478件 |
データ詳細
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| メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 | Medaka EST Database | 10.18908/lsdba.nbdc01000-003 |
クローン毎に遺伝子の発現の局在部位を画像で示したもの。924件。 |
medaka_est_db_expression.zip
(28KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_expression/ |
In Situ Proを用いたin situ hybridization |
- |
924件 |
データ詳細
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| メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 画像ファイル | Medaka EST Database | 10.18908/lsdba.nbdc01000-004 |
メダカ cDNAクローン毎の遺伝子発現の局在部位 画像ファイル。1000個のJPEGファイルをZIP形式で圧縮している。 画像ファイル名は、(クローンのr clusterのID)+(.jpg)となる。 |
medaka_est_db_expression_images.zip
(51.5MB) |
- |
In Situ Proを用いたin situ hybridization |
- |
924件 |
データ詳細
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| メダカ cDNAライブラリ | Medaka EST Database | 10.18908/lsdba.nbdc01000-005 |
Medaka のcDNAライブラリ情報。3件。 |
medaka_est_db_lib.zip
(1KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_est_lib/ |
- |
- |
3件 |
データ詳細
open_in_full
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |