データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cDNA配列のクオリティデータ | Budding yeast cDNA sequencing project | 10.18908/lsdba.nbdc00838-003 |
Phredのクオリティ値。PHD形式で、cDNAデータにつき1ファイルで、tar.gz形式で1つのファイルに圧縮。83,706件。 |
Quality.tar.gz
(45MB) |
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Phredによるベースコール |
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83,706件 |
データ詳細
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| ベクター配列 | Budding yeast cDNA sequencing project | 10.18908/lsdba.nbdc00838-004 |
シークエンシングに使用したベクター配列。マルチFASTA形式。7件。 |
vector_seqeunce.fasta.gz
(1KB) |
- |
- |
7件 |
データ詳細
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| 出芽酵母における完全長cDNAクローンの5'末端塩基配列 | Budding yeast cDNA sequencing project | 10.18908/lsdba.nbdc00838-002 |
出芽酵母のcDNA配列データ。FASTA形式の配列データ、各cDNAにつき１ファイルで、tar.gz形式で1つのファイルに圧縮。83,706件。 |
Sequence.tar.gz
(21MB) |
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シーケンシング |
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83,706件 |
データ詳細
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| 出芽酵母における完全長cDNAクローンの5'末端配列の塩基配列、及びクオリティ値 | Budding yeast cDNA sequencing project | 10.18908/lsdba.nbdc00838-001 |
Vector-capping methodによる出芽酵母完全長cDNAライブラリーから作成した完全長cDNAクローンの5'末端配列、 及びPhredソフトウェアによる配列クオリティ値、及びSGD、dbEST、UCSC Genome Browserへのリンク。 SGDへのリンクは、ゲノムマッピングされたcDNAのみにある。 dbEST、UCSC Genome Browserへのリンクは、その内、5'端が完全なcDNAのみにある。 SGDへのリンク数は、51,027、dbEST、UCSC Genome Browserへのリンク数は、31,847、cDNA総数は83,706。 CSV形式のテキストファイル。 |
yeast_seq_qual.zip
(59.9MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/budding_yeast_cdna_sequencing_project |
塩基配列：シーケンシング
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83,706件 |
データ詳細
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| サンプル情報 | ChemTHEATRE | 10.18908/lsdba.nbdc01632-002.V002 |
環境中から取得したサンプルの情報です。 |
ct_sample.zip
(206 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/ct_sample |
モニタリング |
8,543件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |