データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ORF配列情報 | KAIKOcDNA | 10.18908/lsdba.nbdc00951-003 |
代表ESTのORF一覧です。 |
kaiko_cdna_orf.zip
(11 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kaiko_cdna_orf |
「EST詳細」データ |
200,077 件 |
データ詳細
open_in_full
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| クラスタ一覧 | KAIKOcDNA | 10.18908/lsdba.nbdc00951-002 |
各クラスタにおいて、各クラスタに属する配列の総数と、ライブラリごとに分けた配列の数の一覧です。 |
kaiko_cdna_cluster.zip
(453 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kaiko_cdna_cluster |
「EST詳細」データ |
100bpより長い領域でidentityが95%より大きいクローン同士を同じクラスタとしました。また、各クラスタに属するクローン数をライブラリごとに分けました。 |
59,729 件 |
データ詳細
open_in_full
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| DGroup | KEGG MEDICUS | 10.18908/lsdba.nbdc01185-004.V006 |
KEGG DGROUP は構造的・機能的に類似の医薬品グループを、とくに医薬品相互作用ネットワークの観点から定義しています。 |
kegg_medicus_dgroup.csv.zip
(602 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kegg_medicus_dgroup |
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2,435 件 |
データ詳細
open_in_full
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| Disease | KEGG MEDICUS | 10.18908/lsdba.nbdc01185-003.V006 |
KEGG DISEASE は疾患と遺伝子・分子レベルの情報をつなぐために、既知の病因遺伝子、病原体、発癌物質その他の環境因子などで各疾患を表現したデータベースです。 |
kegg_medicus_disease.csv.zip
(3.2 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kegg_medicus_disease |
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2649 件 |
データ詳細
open_in_full
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| Drug | KEGG MEDICUS | 10.18908/lsdba.nbdc01185-001.V006 |
KEGG DRUG は、日本、米国、欧州の医薬品情報を有効成分の化学構造で一元的に集約し、標的分子や薬物代謝酵素をはじめとした分子間相互作用ネットワークの情報を付加したデータベースです。 |
kegg_medicus_drug.csv.zip
(2.9 MB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kegg_medicus_drug |
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12,190 件 |
データ詳細
open_in_full
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |