データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 膜貫通トポロジーモデル | TMPDB | 10.18908/lsdba.nbdc00973-003 |
実験結果に基づいた302件の膜貫通トポロジーモデルの情報。文献および関連データベースのエントリー情報を総合的に参照して一型のモデルとして提示している。 SWISS-PROT形式ファイル。リリース6.3。 |
TMPDB.dat.gz
(203KB) |
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PubMed、UniProt等での検索 |
実験的裏づけのあるものをマニュアルで抽出し、まとめた。 |
302件 |
データ詳細
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| 膜貫通トポロジーモデル (α-buried構造、Non-redundant) | TMPDB | 10.18908/lsdba.nbdc00973-006 |
実験結果に基づいた膜貫通トポロジーモデルのα-buried構造、Non-redundantセット (7件)。α-buried構造とは、膜に埋もれているが短くて貫通していないαへリックスを含む場合を示す (例：aquaporin 1)。 文献および関連データベースのエントリー情報を総合的に参照して一型のモデルとして提示している。SWISS-PROT形式ファイル。リリース6.3。 |
TMPDB_alpha-buried_nr.dat.gz
(7) |
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7件 |
データ詳細
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| 膜貫通トポロジーモデル (α構造、Non-redundant) | TMPDB | 10.18908/lsdba.nbdc00973-004 |
実験結果に基づいた膜貫通トポロジーモデルのα構造、Non-redundantセット (231件)。文献および関連データベースのエントリー情報を総合的に参照して一型のモデルとして提示している。SWISS-PROT形式ファイル。リリース6.3。 |
TMPDB_alpha_non-redundant.dat.gz
(158KB) |
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231件 |
データ詳細
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| 膜貫通トポロジーモデル (β構造、Non-redundant) | TMPDB | 10.18908/lsdba.nbdc00973-005 |
実験結果に基づいた膜貫通トポロジーモデルのβ構造、Non-redundantセット (15件)。文献および関連データベースのエントリー情報を総合的に参照して一型のモデルとして提示している。SWISS-PROT形式ファイル。リリース6.3。 |
TMPDB_beta_non-redundant.dat.gz
(13KB) |
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15件 |
データ詳細
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| 画像コレクション | Togo Picture Gallery |
生命科学分野で使用される画像のコレクションです。３つのファイルフォーマット(PNG, AI, SVG)で提供しています。 |
Image list (CSV)
(123 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/togo_pic_image#ja | 539 件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |