データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ダイズタンパク質データ（ゲル不使用） | SPD | 10.18908/lsdba.nbdc00238-004 |
ダイズの各器官から浸水条件や時間を変えて採取したサンプルを質量分析計で測定したタンパク質のデータです。 |
soybean_free_proteomics_info.zip
(1.8 MB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/soybean_gelfree_proteomics_info |
質量分析計による測定 |
- |
39,212件 |
データ詳細
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| ダイズタンパク質データ（ゲル使用） | SPD | 10.18908/lsdba.nbdc00238-001 |
ダイズの各器官から浸水条件や時間を変えて採取したサンプルから、ポリアクリルアミドゲルを用いた2次元電気泳動実験によって抽出されたタンパク質のデータです。ゲルについては「 ダイズゲルデータ」を参照してください。 |
soybean_based_proteomics_list.zip
(270 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/soybean_gelbased_proteomics_list |
ポリアクリルアミドゲルを用いた2次元電気泳動実験 |
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484件 |
データ詳細
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| ダイズタンパク質比較データ | SPD | 10.18908/lsdba.nbdc00238-009 |
浸水・乾燥・塩の3種類のストレス下において、葉・胚軸・根の各器官で変化したタンパク質をポリアクリルアミドゲルを用いた2次元電気泳動実験によって抽出したデータです。 |
soybean_comp_proteomics_list.zip
(8 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/soybean_comp_proteomics_list |
ポリアクリルアミドゲルを用いた2次元電気泳動実験 |
- |
349件 |
データ詳細
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| ダイズトランスクリプトームデータ | SPD | 10.18908/lsdba.nbdc00238-005 |
ダイズから浸水条件や時間を変えて採取したサンプルから、HiCEP(High-Coverage Expression Profiling)法によってmRNAのシーケンシングを2回行い、クラスタリングを行ったデータ。
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soybean_transcript.zip
(1.2 MB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/soybean_transcript |
HiCEP(High-Coverage Expression Profiling)法によるシーケンシング |
クラスタリング |
29,388件 |
データ詳細
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| ダイズ代謝データ | SPD | 10.18908/lsdba.nbdc00238-006 |
ダイズから浸水条件や時間を変えて採取したサンプルから、代謝物を抽出して計測したデータ。代謝マップ上にもマッピングしています。 |
soybean_metabolites.zip
(882 KB) |
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質量分析計？ |
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データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |