Soybean Proteome Databaseは、ゲル使用および不使用のプロテオミクス技術により得られたデータを収録しています。
当データベースの目的は、機能解析のためのプロテオミクス情報を提供することにあります。データの多くはダイズからのものですが、これはダイズが植物油脂とタンパク質を提供する重要な作物でありながら、一方で非生物的ストレスに対して非常に敏感であるためです。
当データベースは元々ポリアクリルアミドゲルを用いた2次元電気泳動によって抽出されたタンパク質のデータ（2D-PAGE、ゲル由来タンパク質データベース）から構成されていました。2015年には、質量分析装置を使って取得したゲル不使用のタンパク質データ（ゲルなしタンパク質データベース）が追加されました。
当データベースは、さらに複数のオミックスデータを統合しています。データベース全体として複数のオミックスの手法で統合されていますので、浸水ストレス下にあるタンパク質を時間の経過によって同定することができます。