データのメタデータ一覧
| データ名 ⇅ | データベース名 ⇅ | DOI ⇅ | 説明 ⇅ | データファイル ⇅ | 簡易検索URL ⇅ | データ取得方法 ⇅ | 解析方法 ⇅ | データ件数 ⇅ | データ詳細 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Raw Data (Signal scan format) | PLACE | 10.18908/lsdba.nbdc00168-004 |
各シスエレメントの簡単な説明が含まれている、Signal scanフォーマットのデータ。 |
place.dat.zip
(7.4 KB) |
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Raw Data (ASCII format) のplace.seq から必要な情報を抽出して生成した。 |
469 件 |
データ詳細
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| Reference | PLACE | 10.18908/lsdba.nbdc00168-002 |
文献情報。一つの塩基配列情報 (Main) に対して、一つ以上の文献情報 (Reference) が存在する。 |
place_reference.zip
(52.5 KB) |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/place_reference |
Raw Data (ASCII format) のplace.seq から文献情報を抽出し、CSVファイル (place_reference.zip) を生成した。 |
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900 件 |
データ詳細
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| (Drug Search)クエリサイトリスト | PoSSuM | 10.18908/lsdba.nbdc01144-006 |
(Drug Search)リガンドリストのリガンドに結合するタンパク質上の結合サイト（クエリ）のリストです。 |
possum_query_protein.zip
(40 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_query_protein |
PDB |
2,595件 |
データ詳細
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| (Drug Search)サイト間相同性データ | PoSSuM | 10.18908/lsdba.nbdc01144-010 |
(Drug Search)クエリサイトとターゲットサイトの中で、既知と未知の結合サイト間の相同性を示すデータです。 |
possum_binding_sites_putative_similarity.zip
(5 MB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_binding_sites_putative_similarity |
PDB |
113,495件 |
データ詳細
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| (Drug Search)ターゲットサイトリスト | PoSSuM | 10.18908/lsdba.nbdc01144-007 |
クエリサイトに類似した結合サイト（ターゲット）のリストです。 |
possum_target_protein.zip
(844 KB) |
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_target_protein |
PDB |
55,404件 |
データ詳細
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| データ名 | データベース名 | DOI | 説明 | データファイル | 簡易検索URL | データ取得方法 | 解析方法 | データ件数 | データ詳細 |