[
クレジット
]
寄託者専用サイトログイン
閉じる
ユーザ名
パスワード
自動ログイン
パスワードを忘れましたか?
ユーザ名を忘れましたか?
- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
ホーム
アーカイブの説明
寄託応募要領
更新履歴
データ一覧
利用状況
ヘルプ
お問い合わせ
PoSSuM
(Drug Search)サイト間相同性データ
データ説明
データ名
(Drug Search)サイト間相同性データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01144-010
データ内容の説明
(Drug Search)クエリサイトとターゲットサイトの中で、既知と未知の結合サイト間の相同性を示すデータです。
データファイル
データファイル名:
possum_binding_sites_putative_similarity.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/possum/LATEST/possum_binding_sites_putative_similarity.zip
ファイルサイズ:
5 MB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/possum_binding_sites_putative_similarity
データ取得方法
PDB
解析方法
-
データ件数
113,495件
データ詳細
項目名
項目の説明
Q:PocketIndex
クエリサイトの内部ID
T:PocketIndex
ターゲットサイトの内部ID
Q:PDB_ID
クエリサイトのPDB ID
T:PDB_ID
ターゲットサイトのPDB ID
Q:HET_Code
クエリサイトのHETコード
T:HET_Code
ターゲットサイトのHETコード
Q:ChainID
クエリサイトのある鎖のID
T:ChainID
ターゲットサイトのある鎖のID
Q:Res.No.
クエリサイトのアミノ酸残基番号
T:Res.No.
ターゲットサイトのアミノ酸残基番号
AlignedLength
アミノ酸アライメント長
RMSD
平均二乗偏差
AminoIdentity
アミノ酸の一致率
Q:MolName
クエリの分子名
T:MolName
ターゲットの分子名
Q:EC
クエリのEC ID
T:EC
ターゲットのEC ID
Q:CATH
クエリのCATH ID
T:CATH
ターゲットのCATH ID
Q:SCOPe
クエリのSCOPe ID
T:SCOPe
ターゲットのSCOPe ID
Q:UniProt
クエリのUniProt ID
T:UniProt
ターゲットのUniProt ID
Q:UniRef50
クエリのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
T:UniRef50
ターゲットのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
EC_Df
クエリとターゲットのEC IDの差異の有無
CATH_Df
クエリとターゲットのCATH IDの差異の有無
SCOPe_Df
クエリとターゲットのSCOPe IDの差異の有無
ChEMBL_Assay
ChEMBLのAssay情報の有無
AlignedResidues
アミノ酸残基アライメント結果
このデータベースについて
データベースの説明
ダウンロード
利用許諾
このデータベースの更新履歴