データベースのメタデータ検索
| データベース名称 ⇅ | DOI ⇅ | データベース分類 ⇅ | 生物種 ⇅ | 説明 ⇅ | データベースの特長・有用性・活用方法 ⇅ | 運用場所 ⇅ | 利用許諾 ⇅ |
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RGP gmap
(RGP : RICE GENETIC MAP IN NATURE GENETICS) |
10.18908/lsdba.nbdc00318-01-000 |
植物データベース-イネ
配列, 遺伝子発現
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Oryza sativa
(4530)
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「RICE GENETIC MAP IN NATURE GENETICS」は、イネ連鎖地図作成に使用された1,381個のDNAマーカのデータベースです。イネ連鎖地図は「Nature Genetics volume 8, 365-372, December 1994」に掲載されています。 |
イネ連鎖地図は、Nipponbare (japonica) と Kasalath (indica) のF2交雑でマッピングされた1,381個のRFLPマーカー情報 (1993年版) から構成されています。
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| KAIKOcDNA | 10.18908/lsdba.nbdc00951-000 |
塩基配列データベース
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Bombyx mori
(7091)
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カイコゲノム研究プログラム(SGP)で蓄積されているcDNA(EST)情報が格納されたデータベースです。 |
DDBJのような公的機関に登録し、公開されたカイコの部分的cDNA配列に簡単なアノテーションを付けたデータベースです。このデータベースは、クローン名、BLAST検索スコア、GO（Gene Ontology）ターム、キーワードなどで検索することができ、検索結果からはESTの注釈(アノテーション)やクラスタリング情報を参照できます。「cDNA libraries」には、cDNAライブラリの特性情報、カイコの種類、組織、発育段階などが記載されています。 |
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KNApSAcK MetalMine
(タンパク質金属イオン結合サイト) |
10.18908/lsdba.nbdc01342-000 |
タンパク質データベース
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MetalMineは金属イオン結合タンパク質のデータベースです。最近MetallomeやMetallomicsのような言葉が出てきたことに示されるように、生命システムにおける金属イオンの重要性はますます注目を集めています。しかし我々の知る限り、公に利用できる金属結合タンパク質の完全なリストはありませんでした。そこで私たちは、タンパク質の機能的な金属結合部位を整理するためにこのデータベースを作成しました。
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食・長寿・エコをめざした生物機能研究プラットフォームであるKNApSAcK Familyに統合されたデータベースのうちの１つ。KNApSAcK Familyはメタボロミクスによる食物あるいは生薬としての植物のヒトへの効果を分子レベルで解明する為に構築されました。 |
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| おもしろい糸状菌 | 10.18908/lsdba.nbdc00845-000 |
図鑑
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Fungi
(4751)
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海洋性の糸状菌17種について、顕微鏡写真、学名、形態の説明をまとめています。 |
カビはおもしろい形の胞子を作ったり、おもしろい形のキノコを作ったりします。 色々なカビの顕微鏡写真をご紹介しますので楽しんで下さい。 |
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 北海道農業研究センター |
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PLACE
(A Database of Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements) |
10.18908/lsdba.nbdc00168-000 |
植物データベース-植物データベース全般
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Tracheophyta
(58023)
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高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる領域の塩基配列モチーフを論文から収集し、解説や文献、PubMedへのリンク、国際塩基配列データベースのアクセッション番号などを付加したデータベース。 |
背景・ねらい
特徴・活用方法
有用性
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CC 表示-継承 | |
| データベース名称 | DOI | データベース分類 | 生物種 | 説明 | データベースの特長・有用性・活用方法 | 運用場所 | 利用許諾 |
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