データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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KAIKOcDNA
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名称の読み方
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別名
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00951-000 |
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作成者
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作成氏名
末次克行*
作成者英名
Yoshitaka Suetsugu
作成者所属
農業生物資源研究所
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連絡先
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〒305-8634 茨城県つくば市大わし 1-2 国立研究開発法人 農業生物資源研究所 上樂明也 E-mail : 
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データベース分類
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塩基配列データベース |
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生物種
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データベースの説明
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カイコゲノム研究プログラム(SGP)で蓄積されているcDNA(EST)情報が格納されたデータベースです。 |
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データベースの特長・有用性・活用方法
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DDBJのような公的機関に登録し、公開されたカイコの部分的cDNA配列に簡単なアノテーションを付けたデータベースです。このデータベースは、クローン名、BLAST検索スコア、GO（Gene Ontology）ターム、キーワードなどで検索することができ、検索結果からはESTの注釈(アノテーション)やクラスタリング情報を参照できます。「cDNA libraries」には、cDNAライブラリの特性情報、カイコの種類、組織、発育段階などが記載されています。 |
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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名称
科研費補助金 (No.506015, 1999; No.128102, 2000)
名称
運営費交付金
名称
農林水産省委託プロジェクト「動物ゲノムを活用した新市場創出のための技術開発（昆虫ゲノム情報を活用した新需要創造のための研究）」  |
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論文等
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文献名
Large scale full-length cDNA sequencing reveals a unique genomic landscape in a lepidopteran model insect, Bombyx mori
著者名
Suetsugu Y, Futahashi R, Kanamori H, Kadono-Okuda K, Sasanuma S, Narukawa J,Ajimura M, Jouraku A, Namiki N, Shimomura M, Sezutsu H, Osanai-Futahashi M, Suzuki MG, Daimon T, Shinoda T, Taniai K, Asaoka K, Niwa R, Kawaoka S, Katsuma S,Tamura T, Noda H, Kasahara M, Sugano S, Suzuki Y, Fujiwara H, Kataoka H, Arunkumar KP, Tomar A, Nagaraju J, Goldsmith MR, Feng Q, Xia Q, Yamamoto K, Shimada T, Mita K.
雑誌名/掲載年月/号
G3 (Bethesda) / 2013, Sep / vol.9
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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オリジナルサイト
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http://sgp.dna.affrc.go.jp/EST/ |
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運用開始年月日
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2004/4/12 |
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最終更新年月日
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2011/11/11 |
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統括サイト
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http://sgp.dna.affrc.go.jp/jp/index.html |
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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KAIKObase (http://sgp.dna.affrc.go.jp/KAIKObase/) |
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一覧表示
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有り |
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クエリ検索
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有り |
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Webサービス
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無し |
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WebサービスURL
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ユーザ登録
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無し |