「PLACE」は高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる領域の塩基配列モチーフを論文から収集し、解説等を付加したデータベースです。
「SEVENS」は7本膜貫通ヘリックス型タンパク質のGPCR遺伝子を網羅的に収めたデータベースです。
「KNApSAcK Bicycle」は藻類のタンパク質と二次代謝反応の情報を集めたデータベースです。
「PGDBj - オルソログデータベース」は異なる生物種間におけるアミノ酸配列の類似性に基づいた遺伝子のオルソログ情報を蓄積したデータベースです。
「PGDBj 登録生物種リスト・マーカーリスト・QTLリスト・DBリンク・ゲノム解析手法」はモデル生物と作物を含む植物種について、基本情報、マーカー、QTL、DBリンク、ゲノム解析手法の情報を整理したデータベースです。
「KEGG MEDICUS」は疾患・医薬品・環境物質などのデータを、ゲノム情報を基盤とした生体システム情報として統合したデータベースです。
「MicrobeDB.jp」はゲノム情報を核として様々な微生物学上の知識を統合したデータベースです。
「GenLibi」はJST文献情報JDream IIから得られた遺伝子機能や関連する疾患／表現型を提供するデータベースです。
「Integbioデータベースカタログ」は生命科学系データベースの所在情報 (URL)と、データベースの説明や生物種などの属性情報 (メタデータ)をまとめたデータベースです。
「KNApSAcK Family」（奈良先端科学技術大学院大学 金谷重彦教授）から3つのデータベースを追加しました。
