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生命科学系データベースアーカイブ

INOH

ダウンロード

(※特例として、このページの最下部にはINOHに関連したプログラムINOH clientが収録されていますが、このプログラムはアーカイブに付属するものではなく、従って利用許諾が異なりますのでご注意ください。)

はじめに利用許諾をお読みください。
なお、ここに表示したデータ名およびその説明は、生命科学系データベースアーカイブからダウンロード可能なデータについてのものです。 オリジナルのデータベースの内容とは一致しない場合があります。

「データ名」のリンクをクリックすると、データ項目の説明を参照できます。

#データ名データファイル検索&ダウンロード
1 README README.html -
2 MoleculeRole Ontology inoh_moleculerole_ontology.zip (673KB) 検索&ダウンロード
3 MoleculeRole OntologyのLinkage画像ファイル IMR.zip (17.9MB) -
4 Event Ontology inoh_event_ontology.zip (188KB) 検索&ダウンロード
5 Event OntologyのLinkage画像ファイル IEV.zip (15.6MB) -
6 Location Ontology inoh_location_ontology.zip (5.3KB) 検索&ダウンロード
7 Location OntologyのLinkage画像ファイル ILC.zip (119KB) -
8 Signal Transduction Pathway Data inoh_signal_transduction_pathway.zip (5.7KB) 検索&ダウンロード
9 Metabolic Pathway Data inoh_metabolic_pathway.zip (1KB) 検索&ダウンロード

上記の#2、#4、#6のデータファイルは、下記の#10、#11、#12のデータファイルをCSV形式に加工したものです。
上記の#8、#9のデータファイルは、下記の#13、#14をパスウェイごとに分け、それらへのリンクをCSV形式にまとめたものです。

 

オリジナルサイトのダウンロードファイル

INOHの作成元から提供されたオリジナルのデータファイルです。

#データ名ファイル形式データファイル
10 MoleculeRole Ontology OBO 形式 MoleculeRoleOntology_224.zip (645KB)
11 Event Ontology OBO 形式 EventOntology_172.zip (171KB)
12 Location Ontology OBO 形式 LocationOntology_102.zip (6KB)
13 Signal Transduction Pathway Data INOH 形式 SignalTransductionPathwayDiagrams_110322.zip (3.2MB)
BioPAX Level2 形式 SignalTransductionPathwayBioPAX_l2_110322.zip (3.4MB)
BioPAX Level3 形式 SignalTransductionPathwayBioPAX_l3_110322.zip (3.5MB)
14 Metabolic Pathway Data INOH 形式 MetabolicPathwayDiagrams_110322.zip (868KB)
BioPAX Level2 形式 MetabolicPathwayBioPAX_l2_110322.zip (836KB)
BioPAX Level3 形式 MetabolicPathwayBioPAX_l3_110322.zip (794KB)

 

 

INOH client のダウンロード

キュレーションツールである INOH client 3.5.3 のインストーラです。
INOH client を使って、INOH 形式のパスウェイデータファイルを閲覧・編集することができます。
なお、INOH client の利用許諾は、#1~#14のダウンロードファイルのものとは異なりますので、こちらの利用許諾(ライセンス)に同意の上ご利用ください。

対応OSインストーラ
(Java VMを含む)
インストーラ
(Java VMを含まない)
Windows ダウンロード (46.9MB) ダウンロード (19.1MB)
Mac OS X (10.4以降) - ダウンロード (18.4MB)
Solaris ダウンロード (77.1MB) ダウンロード (25.6MB)
Linux ダウンロード (58.1MB) ダウンロード (25.6MB)

※Java VMのインストールの有無は、こちらのサイトでご確認いただけます。

 

FTPサイトに接続しづらい場合は[こちら]をご利用ください