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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
ショウジョウバエGal4エンハンサートラップ系統の発現情報データテーブル(Strain List) GETDB 10.18908/lsdba.nbdc00236-001

ショウジョウバエGal4エンハンサートラップ系統の系統関連情報、及びエンハンサー活性の発現に関するテキスト情報と発現画像データ。 4,250系統。

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データ詳細 open_in_full
ショウジョウバエGAL4エンハンサートラップ系統の発現画像データ GETDB 10.18908/lsdba.nbdc00236-004

ショウジョウバエの発生段階別の3,075枚の発現画像データ。
画像は下記の4つの発生段階に種別される。
・成虫盤での発現画像
・胚での発現画像
・幼生をGFPで染色した蛍光発現画像
・成体での発現画像
画像ファイルはJPEG形式である。ファイル名は、
「系統に対応する番号」_「発生段階を示すアルファベット1文字(成虫盤(d)、肺(e)、幼生(g)、成体(a))」「系統内での発生段階別の画像の通 し番号」.jpg
となっている(例: 4310_d1.jpg) 。「系統に対応する番号」とDGRC Numberの対応は、ZIPファイル中のdgrcnum_imagenum.csv ファイルに記載されている。

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データ詳細 open_in_full
GGGenome dataset GGGenome dataset 10.18908/lsdba.nbdc01424-001

GGGenome検索用データです。データの種類毎にサブディレクトリにまとめられています。各データは、参照配列ファイル(fasta形式)とGGGenome検索インデックスファイルから構成されます。

参照配列ファイル:
・*.fa

GGGenome検索インデックスファイル:
・*.dna4
・*.doc
・*.fmidx
・*.sa

データ詳細 open_in_full
N結合型糖鎖の修飾位置 (Tax10090 b4GalT1) GlycoProtDB 10.18908/lsdba.nbdc00797-003

Glycosyltransferase isozymeであるβ1,4-galactosyltransferase-I (β4GalT-I) に特異的なターゲットタンパク質 (マウス) について、IGOT法により糖鎖修飾位置を同定したリスト。
文献: Sci Rep. 2012;2:680. Epub 2012 Sep 21. (Pubmed ID:23002422)

IGOT法により糖鎖修飾位置を同定

ペプチド消化、レクチン捕集、IGOT法、LC/MS/MS、β4GalT-I欠損マウスと野生型マウスの比較解析

データ詳細 open_in_full
N結合型糖鎖の修飾位置 (Tax10090) GlycoProtDB 10.18908/lsdba.nbdc00797-002

IGOT法により糖鎖修飾位置を同定したマウスのタンパク質のリスト。
文献: J Proteome Res. 2012 Sep 7;11(9):4553-66. (Pubmed ID:22823882)

IGOT法により糖鎖修飾位置を同定

ペプチド消化、レクチン捕集、IGOT法、LC/MS/MS

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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細