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データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細
CAGE peaks FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-002.V003

CAGE法で計測したRNA転写開始活性に関するピーク領域のデータ。

CAGE法
DPI(Decomposition-based peak identification)法

データ詳細 open_in_full
CAGE peaks identified as true TSS by TSS classifier FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-007.V003

CAGE法で測定した転写開始点の各ピークについて、近傍配列が既知TSSの特徴を持つ(TSS-like)かどうかを評価したもの。ファイル「TSS_human.bed.gz」と「TSS_mouse.bed.gz」は、同定した転写開始点のデータを含む。

TSS Classifier(http://sourceforge.net/p/tometools/wiki/TssClassifier/

データ詳細 open_in_full
CAGE_peaks_annotation FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-010.V003

CAGE法で計測したヒト及びマウスのRNA転写開始活性に関するピーク領域のアノテーション情報。

CAGE法

データ詳細 open_in_full
DRA_accession_tables FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-014.V003

DRA (http://trace.ddbj.nig.ac.jp/dra/index.html)に登録されたFANTOM5サンプルデータのアクセション番号リスト。

DRA

データ詳細 open_in_full
Enhancers FANTOM5 10.18908/lsdba.nbdc01389-004.V003

Phase1およびPhase2において、CAGE法を用いてRNAの転写量を計測し、同定したヒトおよびマウスのエンハンサーのデータ。

CAGE法

データ詳細 open_in_full
データ名 データベース名 DOI 説明 データ取得方法 解析方法 データ詳細