データベース全般 | |||
 名称 | ChIP-Atlas | ||
| 名称の読み方 | チップアトラス | ||
| 別名 | - | ||
| DOI | 10.18908/lsdba.nbdc01558-000.V020 | ||
| バージョン一覧 |
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| 作成者 | |||
| 連絡先 | 〒606-8507 京都市左京区聖護院川原町53 メディカルイノベーションセンター棟 3F | ||
| データベース分類 | ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-ヒトゲノムデータベース/マップ/ビューワ 塩基配列データベース-転写調節部位、転写因子 ゲノミクスデータベース（脊椎動物以外）-ゲノムアノテーション用語、オントロジー、命名法 | ||
| 生物種 | |||
| データベースの説明 | ChIP-Atlas は Sequence Read Archive で公開されている既報のChIP-Seqデータを再解析することによって様々な解析結果を提供し、またユーザデータの解析を可能にするデータベースおよびそのウェブインターフェースである。データ登録者によって記述されたメタデータを再整理することによって、データを組み合わせた様々な結果を提供している。詳しくは https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki を参照のこと。 | ||
| データベースの特長・有用性・活用方法 | ChIP-Atlas を利用することにより、既報の ChIP-Seq データのピーク情報をゲノムブラウザで閲覧したり、転写因子が制御している遺伝子を調べたり、共局在因子を調べたり、ユーザデータを入力としたエンリッチメント解析を行うことができる。 | ||
| データベースの利用許諾 | CC 表示-継承 詳細 | ||
| 予算的背景・プロジェクト | |||
| 論文等 | |||
データベースのオリジナルサイト情報 | |||
| データベース運用場所 | 京都大学大学院 医学研究科 創薬医学講座 | ||
| オリジナルサイト | https://chip-atlas.org/ | ||
| 運用開始年月日 | 2015/12/01 | ||
| 最終更新年月日 | 2021/09/21 | ||
| 統括サイト | - | ||
| データの一括ダウンロードサイト | https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#downloads_doc | ||
| 参照先データベース | - | ||
| 一覧表示 | 有り | ||
| クエリ検索 | 有り | ||
| Webサービス | 無し | ||
| WebサービスURL | - | ||
| ユーザ登録 | 無し | ||
