データ一覧 | LSDBアーカイブ

データのメタデータ一覧

全 696 件 (346件から350件)

件を表示詳細検索

データ名 ⇅	データベース名 ⇅	DOI ⇅	説明 ⇅	データファイル ⇅	簡易検索URL ⇅	データ取得方法 ⇅	解析方法 ⇅	データ件数 ⇅	データ詳細
InterPro search result	KOME	10.18908/lsdba.nbdc00120-021	InterProモチーフデータベースの検索結果	kome_interpro_search_result.zip (2.1 MB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_interpro_search_result	データベースはInterProデータベースバージョン8.0を使用。	完全長cDNAクローンに対してInerProモチーフデータベース検索を行った。 InterProデータベースはバージョン8.0を、InterProプログラムはバージョン3.3を利用している。解析に使われた検索プログラムは以下の９つである。 BlastProDom FPrintScan HMMPfam HMMPIR HMMSmart HMMTigr ProfileScan ScanRegExp SuperFamily	110,589 件	データ詳細 open_in_full
Japonica genome blast search result	KOME	10.18908/lsdba.nbdc00120-011	ジャポニカ種のイネゲノム配列に対してblastn検索した結果	kome_japonica_genome_blast_search_result.zip (802 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_japonica_genome_blast_search_result	2005年10月1日時点でTIGR RICE GENOME DATABASEで公開されているジャポニカ種のイネゲノムコンティグを使用。	ジャポニカ種のイネゲノム配列に対してblastn検索(blast2.2.12)を行った。閾値は1e-10とし、最も相同性が高かったものを表示している。	35,778 件	データ詳細 open_in_full
Main	KOME	10.18908/lsdba.nbdc00120-001	データのリスト	kome_main.zip (1.3 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_main			33 件	データ詳細 open_in_full
Mapping data	KOME	10.18908/lsdba.nbdc00120-003	ジャポニカ種のIRGSPイネゲノム配列とのマッピング情報	kome_mapping_data.zip (723 KB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_mapping_data		ジャポニカ種のIRGSPイネゲノムBACコンティグに対して完全長cDNAクローンのマッピングを行った。	30,643 件	データ詳細 open_in_full
Mapping data detail	KOME	10.18908/lsdba.nbdc00120-004	ジャポニカ種のIRGSPイネゲノム配列との詳細なマッピング情報	kome_mapping_data_detail.zip (2.3 MB)	http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_mapping_data_detail		ジャポニカ種のIRGSPイネゲノムBACコンティグに対して完全長cDNAクローンのマッピングを行った。	154,484 件	データ詳細 open_in_full
データ名	データベース名	DOI	説明	データファイル	簡易検索URL	データ取得方法	解析方法	データ件数	データ詳細