本データ集はカイコの新規参照ゲノム配列(Kawamoto et al., 2019, Insect biochemistry and molecular biology )とカイコP50T系統における複数の器官由来のRNAseqデータから確立した参照トランスクリプトームデータとその関連データである。
「参照トランスクリプトームメタデータ」は新規参照ゲノム配列上での各転写産物の位置情報を示している。
「組織別発現データ」では先述のカイコから取り出した各器官毎の各転写産物のtpm値を示している。
「トランスクリプトームアノテーション情報」は各転写産物をヒトとショウジョウバエのタンパク質のデータセットに対してBLAST検索し、アノテーションを付与したデータを含んでいる。
参照トランスクリプトームデータの予測アミノ酸」は参照トランスクリプトームデータから予測されたアミノ酸配列のマルチfasta fileである。

KNApSAcK Coreは二次代謝物と生物種の関係を蓄積したデータベースである。 50,048種の代謝物と101,500対の生物種とその生物において報告された代謝物の関係を収録している。 オリジナルデータのダウンロードについては、 にご一報ください。

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