データベースのメタデータ検索
| データベース名称 ⇅ | DOI ⇅ | データベース分類 ⇅ | 生物種 ⇅ | 説明 ⇅ | データベースの特長・有用性・活用方法 ⇅ | 運用場所 ⇅ | 利用許諾 ⇅ |
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| The NAISTrap database | 10.18908/lsdba.nbdc00961-000 |
ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-モデル生物、比較ゲノミクス
変異体・発現
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Mus musculus
(10090)
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マウスES細胞中の遺伝子（あるいはその候補）をレトロウイルス型ベクターによってランダムにトラップ（破壊＋マーキング）して得たES細胞クローンの データベース。 どのような遺伝子（あるいはその候補）がトラップされており、ベクターの挿入によってどの程度の欠失が作り出されているか、検索できるようになっている。 また、ジーントラップによって回収された遺伝子断片の実際の塩基配列を見ることもできる。 |
外部の研究者が「NAISTrap データベース」中に興味深い遺伝子を見出し、その遺伝子がトラップされたES細胞クローンをリクエストすることができる。 |
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DGSP Database
(Drosophila Gene Search Project Database) |
10.18908/lsdba.nbdc00418-000 |
ゲノミクスデータベース（脊椎動物以外）-無脊椎動物ゲノムデータベース
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Drosophila melanogaster
(7227)
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ショウジョウバエのGSベクター挿入系統のマップ情報、挿入サイトのゲノム配列、近傍の遺伝子、強制発現される遺伝子、特定のGAL4を使って強制発現を 誘導した時に生じる表現型情報が登録されている。 |
系統については京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センターにおいて維持、配布されている。 |
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EGTC
(Database for the Exchangeable Gene Trap Clones) |
10.18908/lsdba.nbdc00052-000 |
ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-モデル生物、比較ゲノミクス
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Mus musculus
(10090)
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遺伝子を破壊した後で様々な修飾を行うことが出来る可変型遺伝子トラップ法により作製したマウスES細胞のデータベース |
登録しているES細胞の一部はキメラマウスを作製し、マウス系統を樹立している。 マウス胚・精子または成体マウスはCARD R-BASEから供給可能である。 また、部位特異的組換えシステムを用いて、レポーター遺伝子を任意の遺伝子に置換することが可能である。 |
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| Transposon insertion site database - germline | 10.18908/lsdba.nbdc00718-000 |
その他の分子生物学データベース
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Mus musculus
(10090)
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Sleeping Beautyトランスポゾンを用いて作製した変異マウスに関するデータベース。 トランスポゾンの挿入部位と近傍遺伝子を、UCSC等のゲノムデータベースとリンクを貼って示している。 |
変異マウスを供給 |
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KTmAbDB
(C. elegans Monoclonal Antibody Collection) |
10.18908/lsdba.nbdc01038-000 |
局在
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Caenorhabditis elegans
(6239)
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線虫C. elegans胚の特異的な細胞型・組織・細胞内構造を認識するモノクローナル抗体コレクションのデータベース |
線虫C. elegans胚の特異的な細胞種・組織・細胞内構造を認識するモノクローナル抗体コレクションの胚発生過程各時期の免疫染色顕微鏡画像が閲覧可能。 この抗体コレクションは竹田和正博士によって1980年代に作成され、2003年に理研CDB発生ゲノミクス研究チーム（杉本亜砂子チームリーダー）で引 き継いで解析が行われた。 掲載されているモノクローナル抗体のうちストックが残っているものはリクエストにより分与可能 （連絡方法： http://www.cdb.riken.jp/dge/KTmAbDB/firstpage/frame.html ）。 また、Developmental Studies Hybridoma Bank (University of Iowa)にも寄託されている（http://dshb.biology.uiowa.edu/)。 |
理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 発生ゲノミクス研究チーム |
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| データベース名称 | DOI | データベース分類 | 生物種 | 説明 | データベースの特長・有用性・活用方法 | 運用場所 | 利用許諾 |