データベースのメタデータ検索
| データベース名称 ⇅ | DOI ⇅ | データベース分類 ⇅ | 生物種 ⇅ | 説明 ⇅ | データベースの特長・有用性・活用方法 ⇅ | 運用場所 ⇅ | 利用許諾 ⇅ |
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| Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population | 10.18908/lsdba.nbdc00171-000 |
ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般
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Homo sapiens
(9606)
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日本人におけるマイクロサテライトマーカーへテロ接合度のデータベース。日本人集団を対象とした連鎖解析や相関解析に有用なマーカー選択の基盤を整備した。 |
日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度を示すと同時に，連鎖解析に有用なマーカーセット検索，ならびに相関解析に有用な遺伝子領域に位置するマイクロサテライトマーカーの検索が可能な点に特長がある。 |
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TMPDB
(TransMembrane Protein DataBase) |
10.18908/lsdba.nbdc00973-000 |
タンパク質配列データベース-タンパク質の局在とターゲッティング
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収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWISS- PROTなどのデータベースと結びつけることによって、膜貫通トポロジーデータベース (TMPDB) として構築した。 |
TMPDBは膜貫通トポロジー予測法開発や、既存の予測法の改良のためのトレーニングあるいはテストデータセットとして有用である。 |
※オリジナルサイトでの公開を終了 |
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| RA target genes in the Ciona embryo | 10.18908/lsdba.nbdc00960-000 |
マイクロアレイデータ、その他の発現データのデータベース
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Ciona intestinalis
(7719)
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カタユウレイボヤ EST 解析に用いた卵割期・尾芽胚・幼生のライブラリーから、重複のない 9287 クローンの cDNA を載せたマイクロアレイを作製した。このアレイを用いて、 ホヤ胚におけるレチノイン酸標的遺伝子のスクリーニングを行い多くの新規遺伝子を含む標的遺伝子候補を同定し、 それらについて in situ による発現解析を行った。 本データベースはこれらの結果をまとめたデータベースである。 |
このデータベース中の in situ ハイブリダイゼーションのデータは、 ANISEED データベース （http://crfb.univ-mrs.fr/aniseed/） の中にも含まれており，他の論文等で報告されているさまざまな遺伝子発現パターンとともに閲覧できるようになっている。 また、マイクロアレイに用いた cDNA クローンは提供可能である。 |
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DIAM - 安全性に関する文献
(微生物産業利用支援データベース：DataBiosafety for Industrial Applications of Microbes) |
10.18908/lsdba.nbdc01076-02-000 |
文献
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微生物やバイオセーフティ関連情報のデータベース「DIAM」で提供される、安全性に関する文献をまとめたデータベース |
1970年代からの遺伝子組換え体とその技術に関わるバイオセイフティの議論の流れ、科学的知見、リスク評価・管理手法に関する文献を閲覧できる。 |
（財） バイオインダストリー協会 |
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DIAM - バイオテクノロジーの基礎知識
(微生物産業利用支援データベース：DataBiosafety for Industrial Applications of Microbes) |
10.18908/lsdba.nbdc01076-01-000 |
文献
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ＤＩＡＭから提供されている遺伝子組換え微生物やバイオセイフティ関連情報のうち、バイオセイフティに関する基礎知識をまとめたデータベース。
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遺伝子組換え体とその技術をめぐる議論の流れ、歴史、考え方について、一般市民が系統的に理解できる入門編（解説）、Q&A、用語集を閲覧でき る。 |
（財） バイオインダストリー協会 |
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| データベース名称 | DOI | データベース分類 | 生物種 | 説明 | データベースの特長・有用性・活用方法 | 運用場所 | 利用許諾 |