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The NAISTrap database
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
The NAISTrap database
名称の読み方
ナイストラップ データベース
別名
-
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00961-000
作成者
作成氏名
石田 靖雅*
作成者英名
Yasumasa Ishida
作成者所属
奈良先端科学技術大学院大学
連絡先

〒630-0192 奈良県生駒市高山町8916番地の5(けいはんな学研都市)
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科 動物遺伝子機能学講座
E-mail:

データベース分類

ヒト/その他の脊椎動物ゲノム-モデル生物、比較ゲノミクス
変異体・発現

生物種
Taxonomy Name
Mus musculus
Taxonomy ID
データベースの説明

マウスES細胞中の遺伝子(あるいはその候補)をレトロウイルス型ベクターによってランダムにトラップ(破壊+マーキング)して得たES細胞クローンの データベース。 どのような遺伝子(あるいはその候補)がトラップされており、ベクターの挿入によってどの程度の欠失が作り出されているか、検索できるようになっている。 また、ジーントラップによって回収された遺伝子断片の実際の塩基配列を見ることもできる。

データベースの特長・有用性・活用方法

外部の研究者が「NAISTrap データベース」中に興味深い遺伝子を見出し、その遺伝子がトラップされたES細胞クローンをリクエストすることができる。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
文部科学省特定領域研究 ゲノム研究
論文等
文献名
Expression profiling with arrays of randomly disrupted genes in mouse embryonic stem cells leads to in vivo functional analysis.
著者名
Matsuda E, Shigeoka T, Iida R, Yamanaka S, Kawaichi M, Ishida Y.
雑誌名/掲載年月/号
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Mar 23;101(12):4170-4.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
http://bsw3.aist-nara.ac.jp/kawaichi/3kenfile/index.html
運用開始年月日
-
最終更新年月日
2008/04/02
統括サイト
http://bsw3.naist.jp/kawaichi/naistrap.html
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

-

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有り
クエリ検索
無し
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し