データベース全般 | ||||||||||
|
TMPDB | |||||||||
|
|
ティーエムピーディービー | |||||||||
|
|
TransMembrane Protein DataBase | |||||||||
|
|
|
|||||||||
|
|
〒036-8561 弘前市文京町3番地 弘前大学大学院 理工学研究科 電子情報工学科 E-Mail:  |
|||||||||
|
|
|
|||||||||
|
|
- | |||||||||
|
|
収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWISS- PROTなどのデータベースと結びつけることによって、膜貫通トポロジーデータベース (TMPDB) として構築した。 | |||||||||
|
|
TMPDBは膜貫通トポロジー予測法開発や、既存の予測法の改良のためのトレーニングあるいはテストデータセットとして有用である。 | |||||||||
|
|
文部科学省特定領域研究 ゲノム研究 | |||||||||
|
|
|
|||||||||
データベースのオリジナルサイト情報 | ||||||||||
|
|
弘前大学大学院 理工学研究科 電子情報工学科 | |||||||||
|
|
||||||||||
|
|
- | |||||||||
|
|
2003/11 | |||||||||
|
|
- | |||||||||
|
|
ftp://bioinfo.si.hirosaki-u.ac.jp/TMPDB/ | |||||||||
|
|
- | |||||||||
|
|
無し | |||||||||
|
|
無し | |||||||||
|
|
無し | |||||||||
|
|
- | |||||||||
|
|
無し | |||||||||
