| 更新日 | 更新内容 |
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| 2014/08/25 | 連絡先、データベース運用場所、オリジナルサイトおよびデータの一括ダウンロードサイトの内容を修正。 |
| 2012/07/23 | - データの更新 オリジナルサイトのVersion 6.1 相当 (2012/7/23更新) のデータに更新。 収載されたtRNA の件数は、172,143 件から458,123 件に増加。 解析した生物種の数は下記の通り。
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| 2011/08/25 | 利用許諾を更新 |
| 2009/09/10 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2008/07/01 | tRNADB-CE(http://trna.nagahama-i-bio.ac.jp/cgi-bin/trnadb/index.cgi) で公開開始 |
